23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_42020 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_42020  hypothetical protein  100 
 
 		 51 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  65.79 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  64.86 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  62.16 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  62.16 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  59.46 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  59.46 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  51.35 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  52.63 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  56.76 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  48.65 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  50 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  50 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  55.26 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  52.63 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2778  plasmid maintenance system killer  50 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1907  plasmid maintenance system killer  41.18 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000193605  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  55.26 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  55.26 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  55.26 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  48.65 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  48.78 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0577  plasmid maintenance system killer  47.5 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>