42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0577 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0577  plasmid maintenance system killer  100 
 
 		 96 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2778  plasmid maintenance system killer  89.58 
 
 		 96 aa  184  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1485  plasmid maintenance system killer  79.17 
 
 		 96 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2424  plasmid maintenance system killer  42.71 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228875  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  47.42 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  40.43 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  39.36 
 
 		 101 aa  76.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  39.33 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  38.2 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  38.3 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  38.3 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  35.11 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  35.11 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  34.83 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  38.64 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  37.23 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  34.74 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  34.74 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  34.74 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0022  plasmid maintenance system toxin protein HigB  33.33 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00990261  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  30.85 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  34.04 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  30.85 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  34.83 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4041  plasmid maintenance system killer  30.21 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  34.04 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  30.21 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  45.83 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  31.08 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  34.38 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  46.34 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2183  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454111  unclonable  0.000000258126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  29.79 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  34.33 
 
 		 105 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  34.33 
 
 		 112 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3936  plasmid maintenance system killer  28 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  30 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0673  plasmid maintenance system killer protein  29.11 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.139891  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42020  hypothetical protein  47.5 
 
 		 51 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  26.6 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  30.77 
 
 		 93 aa  40  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6420  plasmid maintenance system killer  39.58 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.953679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>