47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2778 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2778  plasmid maintenance system killer  100 
 
 		 96 aa  197  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460932  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0577  plasmid maintenance system killer  89.58 
 
 		 96 aa  184  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1485  plasmid maintenance system killer  79.17 
 
 		 96 aa  167  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2424  plasmid maintenance system killer  45.83 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228875  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  47.42 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  40.43 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  38.3 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  38.2 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  39.33 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  37.23 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  38.2 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  35.79 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  38.64 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  35.79 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  35.79 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  35.11 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  32.58 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0022  plasmid maintenance system toxin protein HigB  31.25 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00990261  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  31.91 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  37.08 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  30.34 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  29.79 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4041  plasmid maintenance system killer  29.17 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  32.58 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  32.86 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  45.83 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  26.6 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  35.94 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  46.34 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2183  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454111  unclonable  0.000000258126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42020  hypothetical protein  50 
 
 		 51 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0607  plasmid maintenance system killer  33.87 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  25.53 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  26.6 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  30 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  32.84 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  32.84 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  29.73 
 
 		 93 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3936  plasmid maintenance system killer  29.33 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1311  plasmid stabilization system protein  44 
 
 		 93 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.648885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  28.72 
 
 		 92 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0673  plasmid maintenance system killer protein  35.19 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.139891  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6420  plasmid maintenance system killer  40.43 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.953679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27680  Plasmid maintenance system killer protein  32.05 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0276  killer suppression protein HigA, putative  27.27 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.853407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>