16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0276 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0276  killer suppression protein HigA, putative  100 
 
 		 109 aa  226  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.853407  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0005  killer suppression protein HigA, putative  36.94 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1442  killer suppression protein HigA, putative  37.5 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061572 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0237  killer suppression protein HigA, putative  34.82 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0316  killer suppression protein HigA, putative  35.85 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000352112 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1195  killer suppression protein HigA, putative  33.93 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2493  plasmid maintenance system killer  31.82 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1549  plasmid maintenance system killer  34.55 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1541  HigA  30.63 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000399058  unclonable  0.0000000000952405 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1952  killer suppression protein HigA, putative  33.93 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20200  plasmid maintenance system killer  32.2 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.668044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0482  hypothetical protein  31.03 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  38.46 
 
 		 101 aa  42  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  37.18 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1485  plasmid maintenance system killer  27.03 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2778  plasmid maintenance system killer  27.27 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>