85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5381 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  100 
 
 
101 aa  212  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  83.7 
 
 
92 aa  170  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  68.82 
 
 
93 aa  141  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  68.82 
 
 
93 aa  140  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  68.82 
 
 
93 aa  140  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  64.13 
 
 
92 aa  124  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  59.78 
 
 
92 aa  122  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  60.87 
 
 
92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  60.87 
 
 
92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  58.7 
 
 
92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  53.26 
 
 
92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  57.61 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  55.43 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  50 
 
 
92 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  47.83 
 
 
92 aa  92  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  47.87 
 
 
114 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  43.48 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  42.55 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1485  plasmid maintenance system killer  42.55 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2778  plasmid maintenance system killer  38.3 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2183  plasmid maintenance system killer  41.3 
 
 
91 aa  77  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454111  unclonable  0.000000258126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0577  plasmid maintenance system killer  39.36 
 
 
96 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1591  plasmid maintenance system killer  38.04 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0593652  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42010  hypothetical protein  51.43 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4041  plasmid maintenance system killer  38.71 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  41.94 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  43.01 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  43.01 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  39.56 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0022  plasmid maintenance system toxin protein HigB  35.87 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00990261  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0090  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0088  plasmid maintenance system killer protein  35.87 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.167827  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  44.26 
 
 
61 aa  64.3  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2424  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228875  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  40.86 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2525  plasmid maintenance system killer  33.7 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4746  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 
93 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1907  plasmid maintenance system killer  31.18 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000193605  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2762  plasmid maintenance system killer  40.22 
 
 
92 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3936  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42020  hypothetical protein  59.46 
 
 
51 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2928  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133815  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2763  plasmid maintenance system killer  36.08 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2694  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2830  plasmid maintenance system killer  36.46 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0714148  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  31.18 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1668  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 
92 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.856327 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1488  hypothetical protein  29.03 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000964732  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3199  plasmid maintenance system killer  35.42 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1212  plasmid maintenance system killer  34.74 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0275  plasmid maintenance system killer  32.53 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292531  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1215  plasmid maintenance system killer  31.18 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1257  plasmid maintenance system killer  33.68 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0146502 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4677  plasmid maintenance system killer  30.77 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0978715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2650  plasmid maintenance system killer  32.53 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.839642  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3186  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0260939  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0020  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 
92 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184323  normal  0.0200834 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0673  plasmid maintenance system killer protein  35.09 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.139891  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  36.07 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  27.96 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  30.11 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0607  plasmid maintenance system killer  34.92 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3069  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67304  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2105  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0223  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.642238  normal  0.270748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4191  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0717347  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2895  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.541001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3425  plasmid maintenance system killer  24 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.835038  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4140  plasmid maintenance system killer  28.26 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543645  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1064  plasmid maintenance system killer  34.15 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6219  plasmid maintenance system killer  34.04 
 
 
93 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2941  plasmid maintenance system killer  35.14 
 
 
94 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00442539  hitchhiker  0.00124461 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0643  hypothetical protein  31.75 
 
 
94 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000101357  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0276  killer suppression protein HigA, putative  38.46 
 
 
109 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.853407  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1124  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.178606 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0833  plasmid maintenance system killer  31.71 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463339  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2851  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4763  plasmid maintenance system killer  34.04 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.561409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>