23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1442 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1442  killer suppression protein HigA, putative  100 
 
 		 113 aa  231  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061572 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1549  plasmid maintenance system killer  48.65 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2493  plasmid maintenance system killer  42.34 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1541  HigA  39.64 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000399058  unclonable  0.0000000000952405 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1195  killer suppression protein HigA, putative  37.5 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1952  killer suppression protein HigA, putative  41.96 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0237  killer suppression protein HigA, putative  34.82 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0276  killer suppression protein HigA, putative  37.5 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.853407  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0005  killer suppression protein HigA, putative  34.82 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20200  plasmid maintenance system killer  36.04 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.668044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0482  hypothetical protein  37.5 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  42.55 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  42.55 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1386  plasmid maintenance system killer  32.39 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  41.38 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  36.67 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  38.6 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0020  plasmid maintenance system killer  42.55 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184323  normal  0.0200834 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  41.67 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1124  plasmid maintenance system killer  42 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0211  hypothetical protein  25.93 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4028  plasmid maintenance system killer  36 
 
 		 94 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1080  plasmid maintenance system killer  32.31 
 
 		 111 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>