89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2830 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2830  plasmid maintenance system killer  100 
 
 		 95 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2763  plasmid maintenance system killer  87.37 
 
 		 95 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1668  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.856327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  40.86 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  44.09 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  40.86 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  39.78 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3069  plasmid maintenance system killer  37.63 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2941  plasmid maintenance system killer  40 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00442539  hitchhiker  0.00124461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2694  plasmid maintenance system killer  38.71 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0020  plasmid maintenance system killer  39.78 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184323  normal  0.0200834 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  41.94 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3242  plasmid maintenance system killer  38.3 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1907  plasmid maintenance system killer  38.71 
 
 		 93 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000193605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 		 93 aa  67  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  46.67 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0607  plasmid maintenance system killer  38.71 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1215  plasmid maintenance system killer  40.86 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1092  hypothetical protein  39.78 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3425  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.835038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5480  plasmid maintenance system killer  41.67 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0673  plasmid maintenance system killer protein  60.53 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.139891  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4028  plasmid maintenance system killer  40 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27680  Plasmid maintenance system killer protein  37.63 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  33.33 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4677  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0978715  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4140  plasmid maintenance system killer  41.94 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0223  plasmid maintenance system killer  40.43 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.642238  normal  0.270748 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0273  plasmid maintenance system killer  36.84 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  32.26 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  47.37 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2928  plasmid maintenance system killer  39.36 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133815  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1586  killer protein, putative  38.3 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2895  plasmid maintenance system killer  38.71 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  32.97 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2020  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6420  plasmid maintenance system killer  43.28 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.953679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3936  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0643  hypothetical protein  32.98 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000101357  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  41.67 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0767  plasmid maintenance system killer  34.38 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  35.42 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2762  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4369  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0624655  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1386  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3199  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0416  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  36.46 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2851  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  34.41 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  34.04 
 
 		 199 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4755  plasmid maintenance system killer  46.77 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4191  plasmid maintenance system killer  35.11 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0717347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1212  plasmid maintenance system killer  33.7 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2105  plasmid maintenance system killer  40.62 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  48.33 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6219  plasmid maintenance system killer  37.5 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  35.11 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  40.98 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3226  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1376  plasmid maintenance system killer  31.25 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4917  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.131575 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  36.46 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2030  plasmid maintenance system killer  30.93 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1488  hypothetical protein  32.26 
 
 		 93 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000964732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2183  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454111  unclonable  0.000000258126 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  31.18 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1424  plasmid maintenance system killer  32.61 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1124  plasmid maintenance system killer  31.18 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178606 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4763  plasmid maintenance system killer  27.66 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.561409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0213  proteic killer protein, putative  41.67 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2424  plasmid maintenance system killer  38.18 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228875  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4132  plasmid maintenance system killer  41.67 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0858239  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3186  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0260939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  31.25 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  29.47 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1591  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0593652  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0482  hypothetical protein  32.53 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2525  plasmid maintenance system killer  28.42 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0090  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0088  plasmid maintenance system killer protein  30.11 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.167827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4746  plasmid maintenance system killer  31.91 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  36.25 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  42.5 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>