81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4132 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4132  plasmid maintenance system killer  100 
 
 
86 aa  179  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0858239  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  70 
 
 
92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  70 
 
 
92 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2895  plasmid maintenance system killer  63.41 
 
 
92 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.541001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1212  plasmid maintenance system killer  66.25 
 
 
93 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1424  plasmid maintenance system killer  59.76 
 
 
93 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1386  plasmid maintenance system killer  60.98 
 
 
92 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3199  plasmid maintenance system killer  59.76 
 
 
92 aa  103  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4191  plasmid maintenance system killer  59.76 
 
 
92 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0717347  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1668  plasmid maintenance system killer  62.96 
 
 
92 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.856327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0020  plasmid maintenance system killer  58.54 
 
 
92 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184323  normal  0.0200834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2020  plasmid maintenance system killer  60.24 
 
 
93 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3242  plasmid maintenance system killer  62.65 
 
 
94 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0554672  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4140  plasmid maintenance system killer  70 
 
 
92 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543645  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4677  plasmid maintenance system killer  57.65 
 
 
93 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0978715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0223  plasmid maintenance system killer  58.02 
 
 
92 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.642238  normal  0.270748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1586  killer protein, putative  58.54 
 
 
92 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2762  plasmid maintenance system killer  58.75 
 
 
92 aa  98.6  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0416  plasmid maintenance system killer  58.54 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6219  plasmid maintenance system killer  62.67 
 
 
93 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5480  plasmid maintenance system killer  60.24 
 
 
91 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0767  plasmid maintenance system killer  67.65 
 
 
93 aa  96.3  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1215  plasmid maintenance system killer  57.83 
 
 
93 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2851  plasmid maintenance system killer  60.87 
 
 
93 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27680  Plasmid maintenance system killer protein  65.71 
 
 
93 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  58.54 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4369  plasmid maintenance system killer  62.82 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0624655  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  56.63 
 
 
199 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3186  plasmid maintenance system killer  60.24 
 
 
93 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0260939  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  61.54 
 
 
93 aa  94  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2694  plasmid maintenance system killer  56.47 
 
 
99 aa  93.6  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3425  plasmid maintenance system killer  59.42 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.835038  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2928  plasmid maintenance system killer  55.29 
 
 
93 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133815  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3226  plasmid maintenance system killer  61.43 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  57.97 
 
 
93 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  58.02 
 
 
92 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2941  plasmid maintenance system killer  62.32 
 
 
94 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00442539  hitchhiker  0.00124461 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1092  hypothetical protein  58.57 
 
 
93 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2105  plasmid maintenance system killer  54.22 
 
 
93 aa  87.8  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0213  proteic killer protein, putative  59.42 
 
 
92 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0607  plasmid maintenance system killer  60.87 
 
 
93 aa  87  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6420  plasmid maintenance system killer  54.22 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.953679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1124  plasmid maintenance system killer  55.07 
 
 
93 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.178606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4917  plasmid maintenance system killer  54.41 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.131575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3615  plasmid maintenance system killer  66.15 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.443505  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4028  plasmid maintenance system killer  51.16 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2030  plasmid maintenance system killer  56.25 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  45 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  45 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3069  plasmid maintenance system killer  47.62 
 
 
92 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67304  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  55.07 
 
 
93 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1488  hypothetical protein  51.47 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000964732  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1376  plasmid maintenance system killer  46.15 
 
 
93 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0643  hypothetical protein  40.96 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000101357  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0273  plasmid maintenance system killer  51.28 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1907  plasmid maintenance system killer  56.25 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000193605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  54.69 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4755  plasmid maintenance system killer  52.05 
 
 
76 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  51.56 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3936  plasmid maintenance system killer  44.58 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  54.84 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0673  plasmid maintenance system killer protein  53.06 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.139891  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0930  putative killer protein  45.9 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2650  plasmid maintenance system killer  42.86 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.839642  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0275  plasmid maintenance system killer  42.86 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292531  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0833  plasmid maintenance system killer  42.03 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463339  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4763  plasmid maintenance system killer  37.04 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.561409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2763  plasmid maintenance system killer  43.33 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1257  plasmid maintenance system killer  40 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0146502 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  35.96 
 
 
92 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1064  plasmid maintenance system killer  42.62 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2830  plasmid maintenance system killer  41.67 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0714148  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4313  plasmid maintenance system killer  37.88 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3184  plasmid maintenance system killer  39.34 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  36.51 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  37.5 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  38.71 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3169  plasmid maintenance system killer  31.94 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0238227  unclonable  0.0000000000000109044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  36.51 
 
 
92 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0432  hypothetical protein  47.83 
 
 
62 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160782  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  43.18 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>