98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1668 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1668  plasmid maintenance system killer  100 
 
 
92 aa  190  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.856327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2895  plasmid maintenance system killer  70.65 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.541001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  69.57 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1215  plasmid maintenance system killer  67.74 
 
 
93 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  67.39 
 
 
92 aa  126  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0223  plasmid maintenance system killer  64.13 
 
 
92 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.642238  normal  0.270748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1212  plasmid maintenance system killer  64.84 
 
 
93 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1092  hypothetical protein  60.22 
 
 
93 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3199  plasmid maintenance system killer  60.87 
 
 
92 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27680  Plasmid maintenance system killer protein  64.52 
 
 
93 aa  120  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4191  plasmid maintenance system killer  60.87 
 
 
92 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0717347  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2928  plasmid maintenance system killer  63.44 
 
 
93 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133815  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0020  plasmid maintenance system killer  60.87 
 
 
92 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184323  normal  0.0200834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3242  plasmid maintenance system killer  59.57 
 
 
94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0554672  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  65.22 
 
 
92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0416  plasmid maintenance system killer  59.78 
 
 
92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2694  plasmid maintenance system killer  63.44 
 
 
99 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  65.22 
 
 
92 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6219  plasmid maintenance system killer  65.59 
 
 
93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  60.22 
 
 
93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4677  plasmid maintenance system killer  59.14 
 
 
93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0978715  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2105  plasmid maintenance system killer  62.37 
 
 
93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1424  plasmid maintenance system killer  60.44 
 
 
93 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1586  killer protein, putative  59.78 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2941  plasmid maintenance system killer  56.99 
 
 
94 aa  114  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00442539  hitchhiker  0.00124461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1386  plasmid maintenance system killer  57.61 
 
 
92 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6420  plasmid maintenance system killer  62.37 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.953679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0213  proteic killer protein, putative  60.87 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4369  plasmid maintenance system killer  59.14 
 
 
94 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0624655  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2762  plasmid maintenance system killer  56.52 
 
 
92 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  63.44 
 
 
93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2020  plasmid maintenance system killer  60.22 
 
 
93 aa  110  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3425  plasmid maintenance system killer  55.91 
 
 
105 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.835038  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0607  plasmid maintenance system killer  58.06 
 
 
93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5480  plasmid maintenance system killer  60.87 
 
 
91 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0767  plasmid maintenance system killer  58.06 
 
 
93 aa  105  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  51.09 
 
 
112 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  56.99 
 
 
199 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2851  plasmid maintenance system killer  55.91 
 
 
93 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  50 
 
 
105 aa  104  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3186  plasmid maintenance system killer  60.64 
 
 
93 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0260939  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3226  plasmid maintenance system killer  53.76 
 
 
95 aa  103  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4140  plasmid maintenance system killer  67.39 
 
 
92 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543645  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4028  plasmid maintenance system killer  56.38 
 
 
94 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4132  plasmid maintenance system killer  62.96 
 
 
86 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0858239  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2030  plasmid maintenance system killer  52.58 
 
 
97 aa  100  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  51.61 
 
 
93 aa  97.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  48.39 
 
 
95 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  49.46 
 
 
93 aa  96.3  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3069  plasmid maintenance system killer  51.09 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67304  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  53.76 
 
 
93 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4917  plasmid maintenance system killer  50.54 
 
 
93 aa  92.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.131575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1124  plasmid maintenance system killer  52.69 
 
 
93 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.178606 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1376  plasmid maintenance system killer  49.46 
 
 
93 aa  92  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1907  plasmid maintenance system killer  50.54 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000193605  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1488  hypothetical protein  49.46 
 
 
93 aa  89  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000964732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3615  plasmid maintenance system killer  58.51 
 
 
94 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.443505  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0643  hypothetical protein  45.16 
 
 
94 aa  88.2  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000101357  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3936  plasmid maintenance system killer  49.46 
 
 
93 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4755  plasmid maintenance system killer  56.58 
 
 
76 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0273  plasmid maintenance system killer  47.31 
 
 
95 aa  83.6  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2830  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0714148  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4763  plasmid maintenance system killer  42.39 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.561409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2763  plasmid maintenance system killer  43.01 
 
 
95 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0833  plasmid maintenance system killer  42.11 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463339  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0930  putative killer protein  41.18 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2650  plasmid maintenance system killer  45 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.839642  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0275  plasmid maintenance system killer  45 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292531  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0673  plasmid maintenance system killer protein  66.67 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.139891  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1064  plasmid maintenance system killer  44.58 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1257  plasmid maintenance system killer  40 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0146502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3184  plasmid maintenance system killer  39.13 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  37.63 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1591  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0593652  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  33.7 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4313  plasmid maintenance system killer  48.39 
 
 
75 aa  52  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  43.33 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0432  hypothetical protein  47.73 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160782  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  40.22 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  31.31 
 
 
94 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3169  plasmid maintenance system killer  39.39 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0238227  unclonable  0.0000000000000109044 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0090  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0088  plasmid maintenance system killer protein  29.03 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.167827  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  37.7 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4746  plasmid maintenance system killer  30.43 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0022  plasmid maintenance system toxin protein HigB  28.12 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00990261  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  38.64 
 
 
114 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4041  plasmid maintenance system killer  36.67 
 
 
101 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2424  plasmid maintenance system killer  31.25 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228875  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2525  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>