70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2448 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  100 
 
 
84 aa  174  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0975  prevent-host-death protein  67.47 
 
 
85 aa  123  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1208  prevent-host-death protein  61.9 
 
 
84 aa  113  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3814  putative YefM protein  57.83 
 
 
84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  59.04 
 
 
84 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1308  prevent-host-death protein  59.04 
 
 
112 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5409  prevent-host-death family protein  57.83 
 
 
86 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4877  prevent-host-death family protein  57.83 
 
 
86 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3489  prevent-host-death protein  57.83 
 
 
86 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00502392  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0844  prevent-host-death protein  59.26 
 
 
86 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0811736 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0554  antitoxin  58.02 
 
 
83 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4765  prevent-host-death family protein  56.63 
 
 
86 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01044  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system, StbD family protein  56.72 
 
 
68 aa  84  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  43.37 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2972  prevent-host-death family protein  44.59 
 
 
78 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3147  prevent-host-death family protein  44.59 
 
 
78 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5998  prevent-host-death protein:addiction module toxin, Txe/YoeB  59.62 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4120  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  40 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0337  prevent-host-death family protein  44 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4634  prevent-host-death protein  40.48 
 
 
107 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374921  normal  0.27831 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  40 
 
 
83 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  40 
 
 
83 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  40 
 
 
83 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  40 
 
 
83 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2940  hypothetical protein  39.51 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4434  prevent-host-death family protein  34.94 
 
 
83 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.318074  normal  0.388841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0028  prevent-host-death protein  36.25 
 
 
86 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0227799  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 
96 aa  60.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2432  prevent-host-death family protein  38.03 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2481  prevent-host-death family protein  37.66 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2433  prevent-host-death family protein  37.66 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  40.3 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3894  prevent-host-death family protein  37.84 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0390  prevent-host-death family protein  36.84 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1841  prevent-host-death protein  38.1 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208689  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  32.53 
 
 
84 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2089  RelB  34.94 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  31.33 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  31.33 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5287  prevent-host-death family protein  39.19 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0662178  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4301  prevent-host-death family protein  37.35 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0123254  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  31.08 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2555  prevent-host-death protein  38.16 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29386  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  29.73 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1845  hypothetical protein  30.12 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745967  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1752  prevent-host-death family protein  35.14 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0588193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0433  prevent-host-death protein  31.33 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6160  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  37.33 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  30.86 
 
 
145 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14180  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 
82 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.662389  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0989  prevent-host-death family protein  35.14 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  27.71 
 
 
83 aa  50.8  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16280  Prevent-host-death protein  35.82 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2039  prevent-host-death family protein  34.33 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2531  prevent-host-death family protein  28.57 
 
 
92 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13393  hypothetical protein  35 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.046844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  30.67 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5485  prevent-host-death protein  34.72 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.822453 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5885  prevent-host-death family protein  34.72 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  33.73 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1663  prevent-host-death family protein  34.62 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  32.43 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11273  hypothetical protein  29.87 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00877977  hitchhiker  0.00820754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7794  hypothetical protein  26.67 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  27.03 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2087  prevent-host-death protein  23.19 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000757578  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  32 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  28.36 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1941  prevent-host-death family protein  25.32 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>