55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2531 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2531  prevent-host-death family protein  100 
 
 
92 aa  186  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2039  prevent-host-death family protein  59.34 
 
 
95 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2432  prevent-host-death family protein  52.87 
 
 
95 aa  92  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2087  prevent-host-death protein  43.33 
 
 
95 aa  76.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000757578  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  40.74 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  43.84 
 
 
83 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  44.16 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3885  prevent-host-death family protein  52.81 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4434  prevent-host-death family protein  32.1 
 
 
83 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.318074  normal  0.388841 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  39.19 
 
 
74 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  37.66 
 
 
83 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4634  prevent-host-death protein  40.85 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374921  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  34.57 
 
 
83 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  34.57 
 
 
83 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  34.57 
 
 
83 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  34.57 
 
 
83 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1845  hypothetical protein  41.1 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745967  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4120  prevent-host-death family protein  39.39 
 
 
72 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4160  prevent-host-death family protein  39.39 
 
 
72 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0390  prevent-host-death family protein  37.33 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1663  prevent-host-death family protein  40.26 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  49.32 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0028  prevent-host-death protein  33.33 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0227799  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1208  prevent-host-death protein  33.33 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  43.55 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  39.06 
 
 
84 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  32.47 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1841  prevent-host-death protein  32.47 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208689  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4120  hypothetical protein  32.14 
 
 
89 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  36.67 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2940  hypothetical protein  30.77 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4765  prevent-host-death family protein  29.58 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5287  prevent-host-death family protein  36.62 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0662178  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  34.72 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  33.82 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5409  prevent-host-death family protein  29.58 
 
 
86 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0844  prevent-host-death protein  29.58 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0811736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0975  prevent-host-death protein  30.86 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4877  prevent-host-death family protein  29.58 
 
 
86 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3489  prevent-host-death protein  29.58 
 
 
86 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00502392  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3894  prevent-host-death family protein  30.56 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4301  prevent-host-death family protein  34.12 
 
 
84 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0123254  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  28.57 
 
 
84 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14180  prevent-host-death family protein  38.03 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.662389  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16280  Prevent-host-death protein  38.78 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3814  putative YefM protein  30.14 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2433  prevent-host-death family protein  25.61 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2481  prevent-host-death family protein  25.61 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041466  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  35.21 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  30.56 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0989  prevent-host-death family protein  34.57 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6160  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  36.36 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5485  prevent-host-death protein  32.18 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.822453 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5885  prevent-host-death family protein  32.18 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>