22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0400 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  70.39 
 
 		 233 aa  345  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  62.07 
 
 		 232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  29.72 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  30.81 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  24.02 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  25 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  27.92 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  29.05 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  27.47 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  26.32 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3499  hypothetical protein  25.62 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2114  putative lipoprotein  23.44 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.458545  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  25.64 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  29.55 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2561  lipoprotein  23.84 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00547331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2893  lipoprotein  26.19 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000297735  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  25.36 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  24.46 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  24.67 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  27.78 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>