45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1431 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  293  5e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  62.5 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  55.7 
 
 		 255 aa  158  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  56.35 
 
 		 189 aa  148  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  55.73 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  45.58 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  53.66 
 
 		 353 aa  124  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  44.88 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  48.91 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  52.43 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  44.93 
 
 		 267 aa  103  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  39.74 
 
 		 288 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  38.89 
 
 		 195 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  38.82 
 
 		 203 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  35.56 
 
 		 265 aa  88.2  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  37.68 
 
 		 188 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  35.07 
 
 		 184 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  45.24 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  43.21 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  39.6 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  41.67 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  38.89 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  34.74 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  41.67 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  36.67 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  40.98 
 
 		 213 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  39.76 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  38.64 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  27.45 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  29.9 
 
 		 329 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  29.21 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  24.51 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1284  hypothetical protein  25 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2170  hypothetical protein  44.07 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2234  hypothetical protein  29 
 
 		 316 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.143589  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  30.77 
 
 		 270 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0109  hypothetical protein  33.96 
 
 		 321 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  29.37 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  29.37 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1640  hypothetical protein  29 
 
 		 319 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0140573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1713  hypothetical protein  29 
 
 		 319 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0219056  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  25.25 
 
 		 316 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2318  carbohydrate-binding family V/XII protein  26.83 
 
 		 841 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  25.51 
 
 		 313 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>