17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3444 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  613  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0293  hypothetical protein  64.86 
 
 
328 aa  371  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000169852  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  58.39 
 
 
270 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0109  hypothetical protein  56.82 
 
 
321 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  50 
 
 
283 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  56.05 
 
 
316 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  41.95 
 
 
329 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1640  hypothetical protein  65.71 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0140573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2234  hypothetical protein  64.57 
 
 
316 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.143589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1713  hypothetical protein  64 
 
 
319 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0219056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  35.64 
 
 
165 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  36.27 
 
 
165 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  30.08 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  27.03 
 
 
213 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  22.77 
 
 
267 aa  45.8  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  26.11 
 
 
188 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  21.62 
 
 
265 aa  43.1  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>