36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2496 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  386  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  54.94 
 
 
188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  50.67 
 
 
183 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  44.39 
 
 
184 aa  148  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  41.83 
 
 
202 aa  131  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  38.53 
 
 
213 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  42.86 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  39.56 
 
 
232 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  39.87 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  44.35 
 
 
187 aa  104  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  38.75 
 
 
203 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  42.98 
 
 
173 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  42.86 
 
 
180 aa  97.8  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  32.39 
 
 
255 aa  97.4  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  40.44 
 
 
353 aa  94  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  34.03 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  49.62 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  34.85 
 
 
288 aa  89.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  35.92 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  36.88 
 
 
135 aa  87.8  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  37.68 
 
 
145 aa  85.5  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  29.84 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  30.48 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  27.81 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  35.48 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  31.82 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  31.82 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  35.65 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  27.59 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  31.71 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  38.68 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  30 
 
 
170 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  30.82 
 
 
165 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  27.62 
 
 
283 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  24.71 
 
 
270 aa  45.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  26.11 
 
 
313 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>