42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1496 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  691    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  48.51 
 
 		 255 aa  139  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  51.88 
 
 		 170 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  49.23 
 
 		 182 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  53.66 
 
 		 145 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  45.67 
 
 		 267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  44.03 
 
 		 189 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  42.5 
 
 		 177 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  45.76 
 
 		 174 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  37.96 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  36.17 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  41.13 
 
 		 135 aa  98.2  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  45.6 
 
 		 171 aa  96.3  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  40.44 
 
 		 188 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  36.43 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  35.14 
 
 		 203 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  41.86 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  38.82 
 
 		 232 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  30.61 
 
 		 214 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  40.48 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  25.95 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  35.07 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  31.65 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  34.02 
 
 		 187 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  45.33 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  32.99 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  40.68 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  38.68 
 
 		 177 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2170  hypothetical protein  45.76 
 
 		 59 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3219  carbohydrate-binding family V/XII protein  26.71 
 
 		 811 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1371  hypothetical protein  31.46 
 
 		 242 aa  50.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2318  carbohydrate-binding family V/XII protein  25.19 
 
 		 841 aa  50.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  31.3 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  29.29 
 
 		 165 aa  46.2  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  32.32 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  27.27 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3064  carbohydrate-binding family V/XII protein  24.14 
 
 		 795 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0110989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3326  carbohydrate-binding family V/XII protein  22.45 
 
 		 794 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  24.49 
 
 		 313 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1232  hypothetical protein  24.14 
 
 		 799 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110653  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1195  hypothetical protein  16.88 
 
 		 289 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>