35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1752 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  353  7.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  38.86 
 
 
188 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  42.28 
 
 
195 aa  111  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  43.31 
 
 
203 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  38 
 
 
213 aa  99  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  38.51 
 
 
188 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  37.91 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  36.81 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  34.44 
 
 
184 aa  84.7  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  40.83 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  34.82 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  33.52 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  35.09 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  32.14 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  38 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  37.06 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  42 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  28.49 
 
 
265 aa  74.7  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  35.64 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  34.43 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  31.55 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  29.2 
 
 
353 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  33.87 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  33.66 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  37.93 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  30.37 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  30.12 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  29.76 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  28.85 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  31.25 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  31.25 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0524  hypothetical protein  35.64 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  45.76 
 
 
111 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>