35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0131 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  50.7 
 
 		 202 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  40.18 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  38.02 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  46.94 
 
 		 173 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  50 
 
 		 195 aa  98.6  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  45.04 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  47.31 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  43.61 
 
 		 184 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  34.42 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  40.54 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  40.74 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  38.97 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  43.52 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  28.11 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  40.48 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  34.75 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  39.6 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  41.05 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  35.2 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  41.18 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  26.97 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  31.31 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  37.5 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  32.43 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  36.78 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  39.78 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  30.83 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  27.54 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  29.37 
 
 		 165 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  33.86 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  33.86 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0524  hypothetical protein  39.6 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  34.12 
 
 		 283 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>