25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1053 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  31.82 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0524  hypothetical protein  49.48 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  35.22 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  32.58 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  34.35 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  27.94 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  31.46 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  33.87 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  29.69 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  25.79 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  28.28 
 
 		 267 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  30.72 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  30.77 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  23.59 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  29.37 
 
 		 145 aa  48.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  31.06 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  28.99 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  29.6 
 
 		 171 aa  45.1  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  29 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  28.75 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  38.89 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  36.36 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>