42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1247 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  56.4 
 
 		 188 aa  190  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  59.79 
 
 		 183 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  43.09 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  46.2 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  45.95 
 
 		 214 aa  130  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  43.93 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  46.07 
 
 		 232 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  39.39 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  38.76 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  51.52 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  50 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  41.46 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  37.56 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  30.77 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  37.21 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  37.04 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  34.51 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  34.88 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  35.11 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  31.38 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  32.35 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  34.51 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  41.38 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  29.79 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  37.63 
 
 		 135 aa  72  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  32.84 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  34.67 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  45.54 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  30 
 
 		 267 aa  64.7  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  36.79 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  36.79 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  33.67 
 
 		 171 aa  62  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  36.61 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4081  hypothetical protein  30.22 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000218694  normal  0.0348171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  29.66 
 
 		 329 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  30.43 
 
 		 313 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2251  hypothetical protein  30.83 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2234  hypothetical protein  29.81 
 
 		 316 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.143589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1640  hypothetical protein  29.09 
 
 		 319 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0140573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1713  hypothetical protein  29.09 
 
 		 319 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0219056  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  34.29 
 
 		 316 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>