40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3620 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  377  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  45.08 
 
 
188 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  48.8 
 
 
188 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  47.49 
 
 
213 aa  137  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  49.73 
 
 
183 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  42.42 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  35.95 
 
 
203 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  37.06 
 
 
214 aa  95.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  36.18 
 
 
195 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  36.76 
 
 
232 aa  91.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  35.82 
 
 
145 aa  88.2  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  34.21 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  29.71 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  32.56 
 
 
288 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  28.98 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  35 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  38.26 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  30.71 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  32.72 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  28.46 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  44.3 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  37.5 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  38.2 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  30.43 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  28.06 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  33.62 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  27.95 
 
 
170 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  39.62 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  28.98 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  29.81 
 
 
165 aa  61.6  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  41.79 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  28.93 
 
 
283 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  26.32 
 
 
313 aa  48.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  25.39 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  25.39 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  26.38 
 
 
270 aa  44.7  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4081  hypothetical protein  30.23 
 
 
273 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000218694  normal  0.0348171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  28.43 
 
 
316 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0109  hypothetical protein  32.86 
 
 
321 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1713  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0219056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>