22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3394 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  535  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0109  hypothetical protein  63.6 
 
 		 321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  61.75 
 
 		 313 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0293  hypothetical protein  67.17 
 
 		 328 aa  285  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000169852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  51.92 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1640  hypothetical protein  66.49 
 
 		 319 aa  254  9e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0140573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2234  hypothetical protein  65.98 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.143589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1713  hypothetical protein  65.46 
 
 		 319 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0219056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  52.52 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  56.6 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  37.86 
 
 		 165 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  38.83 
 
 		 165 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  24.84 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4081  hypothetical protein  27.27 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000218694  normal  0.0348171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4329  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69784 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  20.07 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  24.21 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  24.71 
 
 		 188 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  27.93 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  24.76 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  35.59 
 
 		 882 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  31.37 
 
 		 202 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>