More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0424 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3033  DnaB-like helicase-like  55.57 
 
 		 821 aa  892    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000237623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1893  DnaB domain-containing protein  59.24 
 
 		 807 aa  958    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100629  unclonable  0.0000000000808467 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0424  DnaB domain-containing protein  100 
 
 		 831 aa  1712    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000384079  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  99.17 
 
 		 479 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  35.02 
 
 		 782 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  35.02 
 
 		 782 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4657  DnaB domain-containing protein  33.89 
 
 		 824 aa  432  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.186052  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4838  replicative DNA helicase  33.29 
 
 		 865 aa  426  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  35.06 
 
 		 772 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  32.41 
 
 		 832 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  33.67 
 
 		 1118 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2037  DnaB-like protein helicase  33.33 
 
 		 849 aa  375  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  31.7 
 
 		 749 aa  365  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  69.87 
 
 		 461 aa  335  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  72.03 
 
 		 462 aa  325  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  72.03 
 
 		 462 aa  325  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  73.48 
 
 		 463 aa  324  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  70.89 
 
 		 473 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  73.04 
 
 		 463 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  71.91 
 
 		 461 aa  320  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  71.91 
 
 		 461 aa  320  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  72.81 
 
 		 462 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  70.51 
 
 		 460 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  71.93 
 
 		 460 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  70.51 
 
 		 460 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  70.51 
 
 		 460 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  71.93 
 
 		 460 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  71.93 
 
 		 460 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  71.93 
 
 		 460 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  71.93 
 
 		 460 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  71.93 
 
 		 460 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  71.93 
 
 		 460 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  71.93 
 
 		 460 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  71.93 
 
 		 460 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  70.09 
 
 		 460 aa  314  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  69.66 
 
 		 460 aa  314  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  66.95 
 
 		 473 aa  313  9e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  69.16 
 
 		 465 aa  313  9e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  66.24 
 
 		 468 aa  312  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  57.04 
 
 		 462 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  62.76 
 
 		 472 aa  310  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  71.62 
 
 		 463 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  62.45 
 
 		 462 aa  307  7e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  65.67 
 
 		 472 aa  305  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  64.78 
 
 		 469 aa  303  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  64.58 
 
 		 477 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  62.13 
 
 		 464 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  61.7 
 
 		 465 aa  300  9e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  64.91 
 
 		 461 aa  300  9e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  61.28 
 
 		 465 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  68.8 
 
 		 471 aa  300  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  69.74 
 
 		 470 aa  299  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  61.7 
 
 		 464 aa  299  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  60.85 
 
 		 465 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  60.85 
 
 		 465 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  60.85 
 
 		 465 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  63.4 
 
 		 460 aa  297  5e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  63.4 
 
 		 460 aa  297  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  60.43 
 
 		 463 aa  297  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  64.07 
 
 		 469 aa  296  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  66.12 
 
 		 473 aa  296  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  60.43 
 
 		 464 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  60.43 
 
 		 464 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  64.38 
 
 		 472 aa  295  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  64.38 
 
 		 472 aa  295  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  59.57 
 
 		 464 aa  293  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  65.13 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0905  replicative DNA helicase  63.44 
 
 		 479 aa  291  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0959  primary replicative DNA helicase  62.11 
 
 		 467 aa  291  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  65.65 
 
 		 469 aa  289  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1459  replicative DNA helicase  61.67 
 
 		 467 aa  289  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  58 
 
 		 457 aa  287  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  58 
 
 		 457 aa  287  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  59.39 
 
 		 458 aa  284  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  57.89 
 
 		 473 aa  282  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  55.16 
 
 		 470 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  61.8 
 
 		 476 aa  281  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  61.14 
 
 		 478 aa  280  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  63.09 
 
 		 471 aa  280  8e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  61.14 
 
 		 468 aa  280  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  63.09 
 
 		 471 aa  280  8e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  60.26 
 
 		 468 aa  280  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  61.57 
 
 		 468 aa  279  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  61.14 
 
 		 468 aa  280  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  60.7 
 
 		 468 aa  279  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  61.5 
 
 		 466 aa  279  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  60.26 
 
 		 466 aa  279  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  60.26 
 
 		 465 aa  278  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  61.37 
 
 		 476 aa  278  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  61.14 
 
 		 468 aa  277  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  61.57 
 
 		 470 aa  277  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  60.26 
 
 		 468 aa  277  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  60.26 
 
 		 468 aa  277  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  60.26 
 
 		 468 aa  277  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  60.26 
 
 		 468 aa  277  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  61.14 
 
 		 468 aa  277  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  58.7 
 
 		 472 aa  276  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  61.14 
 
 		 471 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  61.14 
 
 		 471 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  61.14 
 
 		 471 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>