More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1162 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0689  thioredoxin reductase  97.79 
 
 		 318 aa  640    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.200381  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1162  thioredoxin reductase  100 
 
 		 318 aa  656    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.238547 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  80.63 
 
 		 320 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  79.43 
 
 		 317 aa  531  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  80.63 
 
 		 320 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  79.37 
 
 		 320 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  80.63 
 
 		 320 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  80.63 
 
 		 320 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  80.63 
 
 		 320 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  80.63 
 
 		 320 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  80.63 
 
 		 320 aa  527  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  80.63 
 
 		 320 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  79.37 
 
 		 320 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  80.63 
 
 		 320 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  79.37 
 
 		 320 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  78.06 
 
 		 333 aa  524  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  79 
 
 		 333 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  78.73 
 
 		 346 aa  520  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  78.73 
 
 		 320 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  78.73 
 
 		 346 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  78.16 
 
 		 318 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  77.85 
 
 		 318 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  77.36 
 
 		 333 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  77.85 
 
 		 318 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1758  thioredoxin reductase  77.1 
 
 		 326 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.852508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  75.55 
 
 		 321 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  75.32 
 
 		 317 aa  501  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  75.32 
 
 		 317 aa  503  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  75.08 
 
 		 319 aa  502  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  74.84 
 
 		 317 aa  500  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  74.52 
 
 		 316 aa  498  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  75 
 
 		 316 aa  495  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1118  thioredoxin reductase  73.48 
 
 		 316 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  72.78 
 
 		 337 aa  492  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3801  thioredoxin reductase  75.32 
 
 		 328 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  73.31 
 
 		 352 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3213  thioredoxin reductase  75.16 
 
 		 314 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1001  thioredoxin reductase  73.08 
 
 		 345 aa  484  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.24844  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1283  thioredoxin reductase  73.16 
 
 		 319 aa  484  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  73.8 
 
 		 316 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  72.35 
 
 		 317 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  72.26 
 
 		 319 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  69.45 
 
 		 316 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  71.38 
 
 		 316 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  68.69 
 
 		 317 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  70.51 
 
 		 320 aa  464  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  70.83 
 
 		 320 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  70.65 
 
 		 316 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0754  thioredoxin reductase  72.93 
 
 		 321 aa  465  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  69.11 
 
 		 316 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  71.06 
 
 		 320 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  71.06 
 
 		 320 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  70.42 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  70.42 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  69.97 
 
 		 323 aa  461  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  70.97 
 
 		 316 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  71.06 
 
 		 320 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  70.65 
 
 		 316 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  71.47 
 
 		 319 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  71.47 
 
 		 319 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  70.19 
 
 		 319 aa  461  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  70.65 
 
 		 316 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  68.57 
 
 		 316 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  71.06 
 
 		 320 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  71.61 
 
 		 317 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  71.06 
 
 		 318 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  69.68 
 
 		 317 aa  455  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  70.16 
 
 		 318 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  70.32 
 
 		 316 aa  454  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  70.93 
 
 		 321 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  69.75 
 
 		 320 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28230  thioredoxin-disulfide reductase  70.93 
 
 		 315 aa  451  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.75824  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  66.67 
 
 		 319 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  69.68 
 
 		 317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000742143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  68.04 
 
 		 328 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  69.35 
 
 		 317 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  69.13 
 
 		 317 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  69.03 
 
 		 317 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  69.23 
 
 		 315 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  68.27 
 
 		 321 aa  450  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  68.89 
 
 		 320 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  68.27 
 
 		 321 aa  450  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  68.89 
 
 		 320 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  69.01 
 
 		 317 aa  447  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  67.41 
 
 		 316 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  68.71 
 
 		 317 aa  448  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  69.13 
 
 		 317 aa  450  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1932  thioredoxin reductase  68.71 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  68.89 
 
 		 320 aa  450  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  69.43 
 
 		 320 aa  447  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  69.35 
 
 		 317 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  68.39 
 
 		 317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  67.3 
 
 		 322 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  67.3 
 
 		 322 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2258  thioredoxin reductase  68.71 
 
 		 316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000669147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2124  thioredoxin reductase  68.17 
 
 		 316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000128654  normal  0.0108632 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  65.82 
 
 		 320 aa  444  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  68.28 
 
 		 315 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  68.39 
 
 		 317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000784195  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  68.25 
 
 		 319 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>