More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1108 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  77.17 
 
 		 460 aa  742    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  74.03 
 
 		 462 aa  708    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  76.63 
 
 		 475 aa  750    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  82 
 
 		 461 aa  799    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  75.54 
 
 		 462 aa  731    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  74.08 
 
 		 486 aa  701    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  100 
 
 		 460 aa  941    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  74.46 
 
 		 462 aa  711    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2559  phosphomannomutase  70.65 
 
 		 460 aa  688    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.344329  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2141  phosphomannomutase  67.67 
 
 		 463 aa  654    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2443  phosphomannomutase  63.85 
 
 		 472 aa  608  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.299376 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  61.18 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  60.39 
 
 		 462 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  60.7 
 
 		 461 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  60.04 
 
 		 461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  59.83 
 
 		 461 aa  565  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  59.39 
 
 		 461 aa  565  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  59.17 
 
 		 461 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  60.18 
 
 		 458 aa  558  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  58.28 
 
 		 469 aa  551  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  56.74 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0920  Phosphomannomutase  56.74 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3701  phosphomannomutase  56.74 
 
 		 464 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  56.43 
 
 		 485 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  57.52 
 
 		 457 aa  535  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  56.83 
 
 		 457 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3119  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  57.61 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3083  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  57.61 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835798  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0414  phosphomannomutase  57.52 
 
 		 489 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0863  phosphomannomutase  57.52 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0893  phosphomannomutase  57.52 
 
 		 489 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  57.61 
 
 		 961 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2191  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  57.61 
 
 		 472 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3143  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  57.39 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1489  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  57.83 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0374748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2550  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  57.61 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  57.61 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.020226  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  56.95 
 
 		 488 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3990  phosphomannomutase  57.08 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.047705 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0783  phosphomannomutase  56.64 
 
 		 464 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0772  phosphomannomutase  56.64 
 
 		 487 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  58.24 
 
 		 465 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  56.12 
 
 		 854 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  56.12 
 
 		 868 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  55.46 
 
 		 465 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  55.01 
 
 		 465 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  54.17 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  55.68 
 
 		 465 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  56.12 
 
 		 465 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  55.9 
 
 		 463 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  56.07 
 
 		 863 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  55.9 
 
 		 466 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  55.68 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  54.77 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  53.74 
 
 		 461 aa  491  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  53.49 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  52.67 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  52.44 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  53.11 
 
 		 469 aa  482  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  53.67 
 
 		 782 aa  478  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  50.98 
 
 		 782 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  51.97 
 
 		 881 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  50.66 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  47.5 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  47.27 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  45.74 
 
 		 830 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  47.52 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  46.85 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  46.62 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  44.42 
 
 		 449 aa  398  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  47.07 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  43.71 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  44.59 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  46.85 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  43.79 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  45.45 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  44.14 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  46.91 
 
 		 464 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  42.43 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  44.76 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  43.56 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  42.44 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  43.79 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  44.42 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  42.83 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  44.22 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0113  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.21 
 
 		 847 aa  364  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0128  phosphomannomutase  41.99 
 
 		 495 aa  360  2e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  42.64 
 
 		 469 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  40.48 
 
 		 475 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  44.75 
 
 		 460 aa  356  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  43.68 
 
 		 460 aa  352  1e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3316  phosphomannomutase  42.02 
 
 		 467 aa  336  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5049  Phosphomannomutase  42.16 
 
 		 479 aa  330  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.477893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  40.47 
 
 		 469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0623  phosphomannomutase  40.48 
 
 		 452 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  41.58 
 
 		 459 aa  322  9.000000000000001e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  40.83 
 
 		 468 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0306  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  38.44 
 
 		 455 aa  312  9e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0317157  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0666  integral membrane protein  37.5 
 
 		 455 aa  309  8e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0277597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>