More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0794 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0794  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 155 aa  320  3e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  69.68 
 
 		 155 aa  235  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  63.87 
 
 		 155 aa  220  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  63.87 
 
 		 155 aa  220  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  62.58 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 155 aa  209  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  58.6 
 
 		 159 aa  201  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  199  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  59.46 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  56.13 
 
 		 157 aa  193  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0722  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 		 157 aa  190  7e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0592773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  189  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  189  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  54.19 
 
 		 155 aa  189  9e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2822  30S ribosomal protein S7  57.93 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0935176 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 157 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0317  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 158 aa  188  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 179 aa  187  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1832  ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000136289  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3829  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000524662  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  56.08 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000147875  normal  0.0998132 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000237344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3537  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2775e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3715  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3815  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00401885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3644  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103043  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000127849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1312  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4650  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000326428  normal  0.0163007 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3622  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000085728  hitchhiker  0.000566126 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3677  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000012423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0276  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000211572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3920  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000046544  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4008  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  186  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  53.55 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>