More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3634 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3634  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 340 aa  689    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0021  ATPase associated with various cellular activities  57.09 
 
 		 272 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.954404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0036  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.97 
 
 		 272 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0967142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0171  ATPase  55.97 
 
 		 272 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0037  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.97 
 
 		 272 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1102  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.43 
 
 		 281 aa  308  6.999999999999999e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000686062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3309  hypothetical protein  56.02 
 
 		 272 aa  308  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00793915  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2642  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.77 
 
 		 272 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  33.56 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  28.41 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  33.78 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.17 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  27.23 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.4 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.53 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.35 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  29.19 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.18 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1319  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.53 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  32.43 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  28.86 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.43 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  26.32 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  30.46 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  28.12 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  31.54 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.12 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  28.95 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  27.42 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  31.08 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1639  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.96 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  31.08 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.5 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  32.03 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  28.29 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.03 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.89 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  27.52 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  23.46 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.69 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  31.08 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  30.2 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  27.89 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  28.51 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.38 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.829729  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  26.85 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  26.85 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0387  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.76 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  27.52 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  31.08 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1205  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.58 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  29.28 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3272  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.73 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0220778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.29 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.34 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.44 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  24.62 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  28.86 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16660  MoxR-like ATPase  31.08 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  28.96 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.96 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  26.85 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0910  ATPase  28.34 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.63 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.03 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  24.51 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  28.85 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.96 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1196  ATPase  27.08 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.85 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  26.97 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  27.52 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  23.16 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  27.57 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.8 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  26.85 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  29.19 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  29.53 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  29.33 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  27.96 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  26.85 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  26.85 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  26.85 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  28.19 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.85 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  27.96 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  23 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  27.15 
 
 		 324 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  27.17 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  31.13 
 
 		 334 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  31.65 
 
 		 317 aa  53.1  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  30 
 
 		 310 aa  52.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.61 
 
 		 271 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.49 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2054  MoxR-like ATPases  28.86 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0418936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  31.08 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  26.49 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  26.32 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.57 
 
 		 347 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.305004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>