220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2477 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  100 
 
 
438 aa  905  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  47.24 
 
 
394 aa  351  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  47.14 
 
 
433 aa  335  1e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  4.16179e-06  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  46.61 
 
 
390 aa  328  1e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  44.92 
 
 
419 aa  327  2e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  44.74 
 
 
388 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  45.35 
 
 
363 aa  315  1e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  42.02 
 
 
420 aa  295  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  43.55 
 
 
402 aa  282  7e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  39.84 
 
 
444 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  44.77 
 
 
415 aa  268  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  38.48 
 
 
399 aa  252  8e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  40.11 
 
 
433 aa  248  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  37.5 
 
 
402 aa  240  3e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  37.8 
 
 
429 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  38.61 
 
 
444 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  35.42 
 
 
399 aa  215  1e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  38.01 
 
 
311 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  37.54 
 
 
333 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  32.61 
 
 
381 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  35.61 
 
 
338 aa  206  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  36.08 
 
 
307 aa  199  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  37.11 
 
 
312 aa  196  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  33.99 
 
 
602 aa  194  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  34.12 
 
 
315 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  32.52 
 
 
311 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  36.02 
 
 
315 aa  185  1e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.19053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  33.98 
 
 
359 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  30.93 
 
 
328 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.44928e-05  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  32.76 
 
 
313 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  30.56 
 
 
412 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  30.1 
 
 
419 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  32.15 
 
 
350 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  29.24 
 
 
409 aa  177  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  31.67 
 
 
345 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  30.33 
 
 
405 aa  176  1e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  31.67 
 
 
345 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  33.9 
 
 
311 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  30.97 
 
 
412 aa  166  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  29.02 
 
 
449 aa  164  2e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  27.55 
 
 
392 aa  165  2e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  31.37 
 
 
412 aa  165  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  32.54 
 
 
355 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  32.19 
 
 
418 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  30.12 
 
 
342 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  32.94 
 
 
413 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  30.54 
 
 
428 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  30.94 
 
 
326 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  27.99 
 
 
431 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  30.96 
 
 
307 aa  154  3e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.35749e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  30 
 
 
360 aa  149  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  31.74 
 
 
306 aa  147  5e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  28.95 
 
 
344 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  29.06 
 
 
307 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  29.22 
 
 
317 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  29.15 
 
 
320 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  31.64 
 
 
439 aa  143  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  31.68 
 
 
388 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  29.77 
 
 
320 aa  139  8e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  31.34 
 
 
342 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  28.78 
 
 
355 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  30.95 
 
 
307 aa  138  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  30.84 
 
 
315 aa  137  3e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  28.65 
 
 
348 aa  136  6e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  29.06 
 
 
354 aa  135  2e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  29.14 
 
 
307 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  29.47 
 
 
323 aa  133  7e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  28.06 
 
 
342 aa  132  2e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  26.22 
 
 
397 aa  132  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  30.72 
 
 
307 aa  130  4e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  30.36 
 
 
307 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  28.12 
 
 
323 aa  129  7e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  28.48 
 
 
297 aa  129  1e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  30.07 
 
 
337 aa  129  1e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  26.4 
 
 
447 aa  129  1e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  27.16 
 
 
323 aa  128  2e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  27.16 
 
 
323 aa  128  2e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  27.16 
 
 
323 aa  128  2e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  27.16 
 
 
323 aa  128  2e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  27.16 
 
 
323 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  26.84 
 
 
323 aa  127  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  26.84 
 
 
323 aa  127  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  28.29 
 
 
307 aa  126  8e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  27.1 
 
 
450 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  29.17 
 
 
332 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  27.16 
 
 
323 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  26.07 
 
 
448 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  25.71 
 
 
464 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  27.16 
 
 
323 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  26.9 
 
 
323 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  29.8 
 
 
307 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  30.46 
 
 
307 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  30.94 
 
 
393 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  27.96 
 
 
324 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  29.8 
 
 
307 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  27.16 
 
 
323 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  25.71 
 
 
355 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  26.33 
 
 
423 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  25.42 
 
 
355 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  27.16 
 
 
323 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>