62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1148 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1148  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
461 aa  946    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1558  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  54.67 
 
 
458 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2289  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  53.91 
 
 
456 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0787093 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0983  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  53.74 
 
 
459 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2886  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  51.59 
 
 
454 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.85 
 
 
455 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2427  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.52 
 
 
455 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2469  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  51.32 
 
 
467 aa  460  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00142832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0082  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  51.84 
 
 
462 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106273  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7260  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  50.12 
 
 
456 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000104438  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0426  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  51.02 
 
 
450 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2330  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  49.23 
 
 
467 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  48.97 
 
 
466 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0396  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  47.7 
 
 
471 aa  423  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0776  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.88 
 
 
501 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.56 
 
 
430 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  22.51 
 
 
429 aa  90.5  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.14 
 
 
437 aa  87  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.53 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.5 
 
 
437 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.36 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.01 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.18 
 
 
437 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.32 
 
 
496 aa  77  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.87 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.04 
 
 
437 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.45 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  19.94 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.94 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.94 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.5 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  19.94 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.31 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  27.55 
 
 
422 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.96 
 
 
422 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  25.07 
 
 
412 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2592  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.3 
 
 
447 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.69 
 
 
445 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  24.12 
 
 
413 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  26.27 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0344  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.81 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.828514  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.74 
 
 
456 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0697  hypothetical protein  20.47 
 
 
435 aa  51.2  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000533536  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  22.87 
 
 
713 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.02 
 
 
447 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  22.7 
 
 
540 aa  50.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  23.29 
 
 
412 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.38 
 
 
412 aa  50.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  34.38 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  34.38 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  34.38 
 
 
471 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.65 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  21.83 
 
 
417 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  20.73 
 
 
416 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2238  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.69 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.321997  normal  0.249982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  23.9 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1468  hypothetical protein  22.38 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.23 
 
 
411 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4258  phosphonoacetate hydrolase  24.64 
 
 
414 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  21.18 
 
 
417 aa  44.3  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5256  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.91 
 
 
530 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  24.22 
 
 
428 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.872565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>