59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0024 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0024  translation initiation factor SUI1  100 
 
 		 120 aa  244  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.178151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  32.69 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  40.24 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5669  translation initiation factor SUI1  28.43 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2734  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  32.08 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  37.8 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  37.8 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3595  translation initiation factor SUI1  30.7 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.025407 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1267  translation initiation factor Sui1  26 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000000776224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0651  translation initiation factor Sui1  26 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000000000433453  decreased coverage  0.0000613351 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0172  translation initiation factor Sui1  26 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000141332  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0717  translation initiation factor Sui1  26 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3580  translation initiation factor SUI1  29.7 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2142  translation initiation factor Sui1  37.68 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183879  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1391  translation initiation factor Sui1  26 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3549  translation initiation factor SUI1  31.19 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0680444 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0627  translation initiation factor Sui1  27.72 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.344568  normal  0.0369514 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2534  translation initiation factor Sui1  27.72 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  35.37 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  35.37 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2806  translation initiation factor Sui1  31.43 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1568  translation initiation factor Sui1  33.8 
 
 		 121 aa  48.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1589  translation initiation factor SUI1  28.71 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64000  translation initiation factor Sui1  31.63 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1443  translation initiation factor SUI1  32.08 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  normal  0.134693 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27071  translation initiation factor SUI1  37.18 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2419  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  37.7 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5560  translation initiation factor Sui1  31.63 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10953  putative translation initiation factor  40 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.788012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  29.66 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000865275  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1423  translation initiation factor SUI1  31.43 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3941  translation initiation factor SUI1  27.5 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2195  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  28.85 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0976146  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1504  translation initiation factor SUI1  32.22 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3637  translation initiation factor SUI1  29.17 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2099  putative translation initiation factor SUI1  40.98 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0248  translation initation factor SUI1, putative  31.08 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2854  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  32.35 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339586  normal  0.0877983 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2911  translation initiation factor Sui1  27.27 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  29.52 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  32.47 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2075  translation initiation factor SUI1  27.78 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1185  translation initiation factor SUI1  34.94 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00309802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1757  translation initiation factor SUI1  33.03 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1532  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  32.89 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0366  translation initiation factor Sui1  28.87 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485747  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02391  translation initiation factor SUI1  32.89 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0505  translation initiation factor SUI1  31.43 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.583781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0471  translation initiation factor SUI1  29.33 
 
 		 110 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2210  translation initiation factor Sui1  31 
 
 		 99 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000269686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0413  translation initiation factor Sui1  30.48 
 
 		 122 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1997  translation initiation factor Sui1  26.73 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0534  translation initiation factor Sui1  29.9 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0563  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  33.8 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2838  translation initiation factor SUI1  35.94 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179746  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0622  translation initiation factor SUI1  29.9 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0413  translation initiation factor Sui1  29.52 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4092  translation initiation factor SUI1  24.55 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  30.39 
 
 		 114 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.513989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>