More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1258 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1258  ferrochelatase  100 
 
 
348 aa  701    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3617  ferrochelatase  56.3 
 
 
362 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5017  ferrochelatase  55.29 
 
 
348 aa  343  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400702  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2972  ferrochelatase  50.57 
 
 
346 aa  337  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1186  ferrochelatase  49.04 
 
 
315 aa  315  8e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2474  ferrochelatase  48.25 
 
 
362 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0395  ferrochelatase  41.46 
 
 
343 aa  279  6e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0790  ferrochelatase  49.2 
 
 
325 aa  271  2e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0623  ferrochelatase  40.24 
 
 
337 aa  266  4e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.235291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4517  ferrochelatase  45.99 
 
 
387 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000264771  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0845  ferrochelatase  41.72 
 
 
335 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000855481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  39.89 
 
 
387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07661  ferrochelatase  44.1 
 
 
391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0342613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  42.65 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  42.65 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  42.9 
 
 
387 aa  253  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45357  predicted protein  41.69 
 
 
509 aa  253  4.0000000000000004e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0976017  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2831  predicted protein  43.17 
 
 
366 aa  251  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00315896  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  43.89 
 
 
388 aa  250  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  42.63 
 
 
387 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  41.47 
 
 
387 aa  250  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05281  ferrochelatase  42.42 
 
 
391 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1503  ferrochelatase  43.12 
 
 
312 aa  249  5e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  43.12 
 
 
391 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  42.28 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  41.23 
 
 
391 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05821  ferrochelatase  40.12 
 
 
391 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1857  ferrochelatase  40.12 
 
 
391 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.89761  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05511  ferrochelatase  40.99 
 
 
391 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0173  ferrochelatase  40.74 
 
 
319 aa  238  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05811  ferrochelatase  41.61 
 
 
391 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0862606  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0525  ferrochelatase  41.49 
 
 
391 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.703212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3312  ferrochelatase  40.74 
 
 
317 aa  235  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00205193  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2715  ferrochelatase  39.56 
 
 
322 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0019  ferrochelatase  41.74 
 
 
317 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0039  ferrochelatase  39.06 
 
 
317 aa  222  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1130  ferrochelatase  42.5 
 
 
319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104879  hitchhiker  0.00676039 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0038  ferrochelatase  38.75 
 
 
317 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0641223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2930  ferrochelatase  38.32 
 
 
316 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1198  ferrochelatase  40.29 
 
 
443 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1218  Ferrochelatase  43.52 
 
 
320 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1090  ferrochelatase  42.59 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0770  ferrochelatase  37.65 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1149  Ferrochelatase  43.08 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0918  ferrochelatase  35.44 
 
 
316 aa  191  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101664  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1670  ferrochelatase  33.23 
 
 
312 aa  182  6e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0988  ferrochelatase  34.15 
 
 
312 aa  171  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01700  ferrochelatase, putative  35.91 
 
 
413 aa  169  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0703  ferrochelatase  32.49 
 
 
314 aa  166  4e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0053  ferrochelatase  33.54 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2206  ferrochelatase  30.75 
 
 
330 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0613952  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0610  ferrochelatase  34.27 
 
 
303 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.926829  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1433  ferrochelatase  34.62 
 
 
303 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0531  ferrochelatase  34.27 
 
 
309 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.95446  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  32.19 
 
 
368 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  32.42 
 
 
364 aa  152  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1069  ferrochelatase  33.8 
 
 
300 aa  152  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  32.61 
 
 
364 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  32.92 
 
 
371 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07752  mitochondrial ferrochelatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07750)  31.96 
 
 
419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.412365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  30.09 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  30.65 
 
 
370 aa  146  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  30.43 
 
 
369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  29.91 
 
 
355 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  30.09 
 
 
327 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  32.52 
 
 
321 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  29.78 
 
 
327 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  35.96 
 
 
328 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  29.78 
 
 
327 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  32.61 
 
 
355 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  31.06 
 
 
354 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  31.86 
 
 
367 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  29.27 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  32.1 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  30.56 
 
 
356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  30.56 
 
 
356 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4417  ferrochelatase  29.62 
 
 
357 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36859  ferrochelatase precursor  31.55 
 
 
354 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  31.68 
 
 
354 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  30.72 
 
 
339 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  30.84 
 
 
353 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  28.62 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  31.46 
 
 
339 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  28.84 
 
 
337 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  29.88 
 
 
344 aa  136  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  31.76 
 
 
367 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  31.76 
 
 
367 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  31.99 
 
 
354 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  31.99 
 
 
354 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  31.76 
 
 
367 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  31.76 
 
 
367 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  31.76 
 
 
367 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  30.41 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  31.76 
 
 
367 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  29.41 
 
 
359 aa  135  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  33.52 
 
 
367 aa  135  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  31.76 
 
 
367 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  29.01 
 
 
337 aa  135  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  30.22 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  29.81 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>