More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2587 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  100 
 
 
270 aa  534  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  63.94 
 
 
269 aa  346  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  58.65 
 
 
269 aa  319  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  58.67 
 
 
288 aa  318  5e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  54.55 
 
 
273 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  52.03 
 
 
273 aa  278  7e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  53.45 
 
 
299 aa  275  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  52.01 
 
 
273 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  47.67 
 
 
274 aa  228  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.15 
 
 
278 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  44.53 
 
 
272 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  41.79 
 
 
276 aa  201  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  41.79 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  43.32 
 
 
284 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  44.8 
 
 
218 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  42.4 
 
 
272 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  44 
 
 
381 aa  189  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  40.15 
 
 
278 aa  182  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  42.34 
 
 
283 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  40 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  36.23 
 
 
279 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  39.2 
 
 
281 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  39.36 
 
 
281 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  40.71 
 
 
303 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  33.22 
 
 
279 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  36 
 
 
272 aa  158  9e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  33.46 
 
 
273 aa  155  6e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  34.35 
 
 
287 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.56 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  36.78 
 
 
285 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  37.45 
 
 
307 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  33.09 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  35.32 
 
 
273 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  39.36 
 
 
285 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  39.76 
 
 
284 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  33.33 
 
 
272 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  33.95 
 
 
271 aa  142  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  34.55 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  33.94 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  32.61 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  33.7 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.02 
 
 
277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  30.32 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  33.2 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  33.09 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  31.82 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0128  phosphate binding protein  33.96 
 
 
307 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  35.71 
 
 
274 aa  132  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  36.33 
 
 
285 aa  131  9e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  33.85 
 
 
270 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  30.29 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  32.41 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  35.71 
 
 
332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  32.8 
 
 
276 aa  129  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  36.9 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  34.26 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.86 
 
 
293 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  33.82 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2295  phosphate-binding protein  32.09 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  36.78 
 
 
278 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  37.13 
 
 
292 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  33.33 
 
 
281 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  32.49 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13780  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.51 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0228402  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  36.62 
 
 
301 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  32.68 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  31.2 
 
 
282 aa  118  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  33.33 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  28.85 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  32.68 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  32.42 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  33.98 
 
 
281 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.6 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.16 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.67 
 
 
286 aa  115  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  32.32 
 
 
278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  34.29 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  31.1 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  32.05 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.39 
 
 
288 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 
268 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1605  phosphate ABC transporter (binding protein)-like protein  45.8 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00137647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  32.22 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4766  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate- binding protein  30.33 
 
 
267 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  33.06 
 
 
292 aa  108  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.2 
 
 
302 aa  108  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.15 
 
 
300 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  32.41 
 
 
294 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  30.77 
 
 
328 aa  106  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  31.65 
 
 
562 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2840  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.96 
 
 
268 aa  105  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  29.58 
 
 
274 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  32.56 
 
 
482 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1379  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  42.65 
 
 
327 aa  104  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000788807  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.67 
 
 
279 aa  104  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  28.47 
 
 
273 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  27.91 
 
 
274 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  31.68 
 
 
309 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  27.2 
 
 
274 aa  102  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>