62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2038 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  100 
 
 
725 aa  1494    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  35.06 
 
 
732 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  34.48 
 
 
718 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  34.18 
 
 
786 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  33.7 
 
 
718 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  33.7 
 
 
718 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  33.79 
 
 
718 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  33.43 
 
 
718 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  34.12 
 
 
718 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  32.02 
 
 
731 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  34.02 
 
 
718 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  34.02 
 
 
718 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  32.87 
 
 
718 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  33.24 
 
 
718 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  33.47 
 
 
718 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  33.56 
 
 
718 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  32.64 
 
 
718 aa  381  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  33.15 
 
 
718 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  34.26 
 
 
738 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  33.01 
 
 
718 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  0.0000320991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  32.53 
 
 
743 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000436948  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  32.81 
 
 
721 aa  375  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  33.06 
 
 
720 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  32.12 
 
 
732 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  33.57 
 
 
707 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  31.81 
 
 
732 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  31.81 
 
 
732 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  32.44 
 
 
732 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  0.00000000353181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  31.67 
 
 
734 aa  369  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  32.35 
 
 
732 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  31.38 
 
 
739 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000122811  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  32.24 
 
 
716 aa  365  1e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  32.21 
 
 
732 aa  364  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  31.95 
 
 
732 aa  364  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000601769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  32.21 
 
 
732 aa  363  6e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  0.0000935307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  33.11 
 
 
714 aa  362  9e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  31.34 
 
 
731 aa  360  4e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  33.33 
 
 
715 aa  359  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  31.68 
 
 
732 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  0.000040961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  31.99 
 
 
941 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  30.94 
 
 
740 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000133423  hitchhiker  0.0000000733664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  32.44 
 
 
729 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000942986  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  32.85 
 
 
767 aa  354  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  31.71 
 
 
722 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  31.88 
 
 
716 aa  351  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000205718  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  32.21 
 
 
720 aa  349  1e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  31.52 
 
 
704 aa  349  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  32.2 
 
 
718 aa  343  7e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  32.22 
 
 
721 aa  340  5e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  32.52 
 
 
714 aa  338  1.9999999999999998e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  30.42 
 
 
712 aa  318  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  26.51 
 
 
714 aa  196  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  26.16 
 
 
701 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  25.99 
 
 
710 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  25.71 
 
 
706 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  25.41 
 
 
706 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  25.04 
 
 
706 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  23.95 
 
 
751 aa  170  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  24.41 
 
 
711 aa  167  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654767 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  23.8 
 
 
688 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  24.33 
 
 
759 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  30.86 
 
 
713 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>