76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1913 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1913  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  239  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.915766  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  34.12 
 
 
95 aa  64.3  5e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 
96 aa  64.3  5e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  36.26 
 
 
111 aa  63.9  7e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  31.4 
 
 
96 aa  59.7  1e-08  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  30.85 
 
 
95 aa  59.7  1e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 
107 aa  60.1  1e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  4.08802e-05  hitchhiker  5.27007e-05 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.72 
 
 
100 aa  58.5  3e-08  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  35.23 
 
 
118 aa  58.5  3e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  35.23 
 
 
118 aa  58.5  3e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  36.78 
 
 
101 aa  58.2  4e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  34.09 
 
 
118 aa  58.2  4e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  32.22 
 
 
101 aa  57.8  5e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.22 
 
 
96 aa  57.4  6e-08  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  29.55 
 
 
97 aa  57.4  7e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  8.20325e-08  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  29.03 
 
 
95 aa  56.6  1e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  31.11 
 
 
101 aa  55.5  2e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  35.16 
 
 
95 aa  55.5  2e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  31.46 
 
 
97 aa  55.5  2e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  31.11 
 
 
110 aa  55.8  2e-07  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  35.48 
 
 
100 aa  54.7  4e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  28.42 
 
 
95 aa  53.9  7e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  36.05 
 
 
109 aa  53.5  1e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  33.72 
 
 
110 aa  53.1  1e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  27.96 
 
 
95 aa  52.8  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  31.4 
 
 
98 aa  52.4  2e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  29.35 
 
 
100 aa  52.4  2e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  27.96 
 
 
95 aa  52.4  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  29.21 
 
 
95 aa  52  3e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  31.4 
 
 
95 aa  51.6  4e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  33.72 
 
 
96 aa  50.4  7e-06  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  33.71 
 
 
130 aa  50.4  7e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  33.72 
 
 
96 aa  50.4  7e-06  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  29.03 
 
 
120 aa  50.4  8e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  32.94 
 
 
95 aa  50.4  9e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  28.57 
 
 
107 aa  50.1  1e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  28.24 
 
 
95 aa  48.9  2e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.46 
 
 
95 aa  49.3  2e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  32.56 
 
 
98 aa  48.9  2e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  30.11 
 
 
96 aa  48.9  2e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  30.11 
 
 
96 aa  49.3  2e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  30.34 
 
 
95 aa  48.9  2e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  30.59 
 
 
125 aa  48.9  2e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  27.08 
 
 
107 aa  49.3  2e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  29.89 
 
 
102 aa  48.9  2e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  28.74 
 
 
102 aa  48.5  3e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  27.59 
 
 
99 aa  47.8  5e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  29.07 
 
 
99 aa  47.8  5e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  30.77 
 
 
115 aa  47.4  7e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  29.21 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  29.21 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  29.41 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  30.23 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  31.25 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  29.21 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  25.56 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  29.41 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  27.06 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  29.07 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  28.24 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  27.91 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  25.71 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  28.24 
 
 
121 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.85 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  30.26 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.16284e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  29.49 
 
 
97 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  29.49 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>