More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0013 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 
332 aa  686    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  75.38 
 
 
334 aa  528  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  66.24 
 
 
323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  66.89 
 
 
324 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  67.11 
 
 
323 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  63.04 
 
 
331 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  65.79 
 
 
322 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  66.56 
 
 
320 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.9 
 
 
330 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  62.35 
 
 
329 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  65.13 
 
 
325 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  64.05 
 
 
320 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  65.13 
 
 
325 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  60.84 
 
 
317 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  59.55 
 
 
322 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  59.61 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  59.67 
 
 
310 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  58.58 
 
 
348 aa  391  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  59.47 
 
 
312 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  58.14 
 
 
333 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  56.91 
 
 
304 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  56.11 
 
 
310 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  56.11 
 
 
310 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  56.44 
 
 
304 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  56.77 
 
 
304 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  56.44 
 
 
304 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  56.58 
 
 
328 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  55.77 
 
 
332 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  55.7 
 
 
329 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  56.91 
 
 
328 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  56.11 
 
 
311 aa  363  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  55.26 
 
 
324 aa  353  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  53.62 
 
 
318 aa  353  2e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  55.59 
 
 
323 aa  352  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  54.05 
 
 
314 aa  350  1e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  54.4 
 
 
313 aa  349  4e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  52.12 
 
 
321 aa  345  5e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  53.14 
 
 
322 aa  341  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.07 
 
 
311 aa  340  2e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  49.53 
 
 
319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  50.48 
 
 
308 aa  315  7e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0969  quinolinate synthetase  48.52 
 
 
315 aa  309  4e-83  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.814185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  52.27 
 
 
307 aa  309  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.98 
 
 
307 aa  308  9e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  50.99 
 
 
331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  49 
 
 
298 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.67 
 
 
324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  48.84 
 
 
303 aa  299  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.73 
 
 
303 aa  297  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  48.04 
 
 
304 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  49.51 
 
 
334 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.86 
 
 
301 aa  292  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  45.9 
 
 
308 aa  291  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  48.6 
 
 
318 aa  291  1e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  49.33 
 
 
304 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  49.01 
 
 
306 aa  290  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  47.85 
 
 
304 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  45.37 
 
 
308 aa  288  1e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1159  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.8 
 
 
341 aa  287  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  48.36 
 
 
334 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  49.17 
 
 
306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  48.36 
 
 
334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  48.36 
 
 
334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  48.01 
 
 
304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  47.68 
 
 
304 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  48.5 
 
 
304 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.19 
 
 
306 aa  280  3e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  46.01 
 
 
332 aa  279  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  47.02 
 
 
304 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0746  quinolinate synthetase  42.95 
 
 
356 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  46.41 
 
 
305 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  47.83 
 
 
304 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  47.04 
 
 
323 aa  276  3e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  44.92 
 
 
304 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.89 
 
 
346 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.21 
 
 
304 aa  275  9e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0026  quinolinate synthetase  43.17 
 
 
370 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44147  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0903  quinolinate synthetase  44.13 
 
 
377 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0600  quinolinate synthetase  43.63 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.287851  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0891  quinolinate synthetase  42.82 
 
 
358 aa  273  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000130385  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.79 
 
 
323 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  47.02 
 
 
306 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3497  quinolinate synthetase  43.99 
 
 
374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0545578  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.55 
 
 
348 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3850  quinolinate synthetase  43.49 
 
 
375 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  48.49 
 
 
302 aa  270  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2820  quinolinate synthetase  43.67 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1964  quinolinate synthetase  42.72 
 
 
395 aa  269  5e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.07 
 
 
303 aa  269  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  46.15 
 
 
326 aa  268  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0632  quinolinate synthetase  43.23 
 
 
379 aa  268  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.57 
 
 
304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1319  quinolinate synthetase  42.22 
 
 
378 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.83 
 
 
302 aa  265  5e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0938  quinolinate synthetase  43.49 
 
 
377 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.28 
 
 
349 aa  265  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0256  quinolinate synthetase  41.72 
 
 
357 aa  265  7e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  46.67 
 
 
302 aa  263  4e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.25 
 
 
295 aa  263  4e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  46.67 
 
 
302 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>