More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5463 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  86.97 
 
 
500 aa  888    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  89.18 
 
 
500 aa  907    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  88.98 
 
 
526 aa  903    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
500 aa  1013    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  77.11 
 
 
501 aa  793    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  74.8 
 
 
501 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  86.37 
 
 
500 aa  887    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  74.4 
 
 
506 aa  777    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  80.36 
 
 
500 aa  819    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  86.57 
 
 
500 aa  887    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  85.77 
 
 
500 aa  863    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  53.88 
 
 
508 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  50.61 
 
 
500 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  50.1 
 
 
505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  48.77 
 
 
497 aa  450  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  49.59 
 
 
499 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  49.26 
 
 
508 aa  422  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  48.84 
 
 
508 aa  412  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1205  Ppx/GppA phosphatase  45.47 
 
 
512 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  45.12 
 
 
501 aa  405  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  44.98 
 
 
499 aa  405  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2123  Ppx/GppA phosphatase  45.59 
 
 
477 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  49.06 
 
 
506 aa  402  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  44.91 
 
 
509 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  41.47 
 
 
505 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  42.69 
 
 
520 aa  393  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  45.87 
 
 
499 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  42.14 
 
 
509 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  43.31 
 
 
506 aa  388  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  43.48 
 
 
509 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  43.51 
 
 
511 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  45.36 
 
 
499 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  43.25 
 
 
491 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2160  exopolyphosphatase  43.51 
 
 
511 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  42.28 
 
 
513 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  43.06 
 
 
508 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1158  Ppx/GppA phosphatase  45.21 
 
 
503 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.776682  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  40.57 
 
 
502 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0434  Ppx/GppA phosphatase  44.56 
 
 
507 aa  375  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1441  exopolyphosphatase  45.21 
 
 
503 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  41.37 
 
 
511 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  43.53 
 
 
500 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  42.62 
 
 
509 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  41.9 
 
 
519 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  41.9 
 
 
519 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  41.98 
 
 
501 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  41.82 
 
 
511 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  41.9 
 
 
501 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  41.7 
 
 
519 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  42.44 
 
 
513 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  42.44 
 
 
526 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  42.44 
 
 
526 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  42.44 
 
 
526 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  42.44 
 
 
526 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  41.92 
 
 
516 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  40.85 
 
 
513 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  40.85 
 
 
513 aa  362  6e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  40.85 
 
 
513 aa  362  6e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  40.85 
 
 
513 aa  362  6e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  40.85 
 
 
513 aa  362  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  40.85 
 
 
513 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  40.85 
 
 
513 aa  362  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  40.65 
 
 
513 aa  362  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  40.65 
 
 
513 aa  362  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  43.18 
 
 
535 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  41.77 
 
 
504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  41.72 
 
 
504 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1537  exopolyphosphatase protein  40.27 
 
 
527 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  41.57 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  41.57 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  41.57 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  41.57 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  41.57 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  41.57 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  41.57 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1710  Ppx/GppA phosphatase  41.22 
 
 
512 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00230463  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  41.4 
 
 
504 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  41 
 
 
501 aa  354  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  41.52 
 
 
504 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2018  Ppx/GppA phosphatase  41.03 
 
 
512 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.84 
 
 
498 aa  353  5e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  41.42 
 
 
510 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  40.87 
 
 
509 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  41.37 
 
 
504 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2177  Ppx/GppA phosphatase  40.83 
 
 
510 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2850  Ppx/GppA phosphatase  41.45 
 
 
503 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542299  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  41.16 
 
 
504 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  41.16 
 
 
504 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  41.16 
 
 
504 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.5 
 
 
500 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  40.73 
 
 
518 aa  347  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.07 
 
 
498 aa  343  4e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  39.32 
 
 
494 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  39.32 
 
 
494 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.32 
 
 
494 aa  341  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.32 
 
 
494 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.32 
 
 
494 aa  341  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1483  Ppx/GppA phosphatase  43.23 
 
 
493 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.899427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.32 
 
 
494 aa  341  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2375  Ppx/GppA phosphatase  43.23 
 
 
493 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>