More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0026 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  78.31 
 
 
503 aa  825  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  80.68 
 
 
505 aa  862  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  100 
 
 
510 aa  1061  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  85.23 
 
 
501 aa  912  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  80.68 
 
 
505 aa  860  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  78.04 
 
 
502 aa  827  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  80.28 
 
 
505 aa  857  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  9.26567e-05 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  77.11 
 
 
503 aa  804  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  84.63 
 
 
501 aa  905  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  80.08 
 
 
505 aa  857  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.95462e-10 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  59.72 
 
 
517 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  59.72 
 
 
522 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  59.72 
 
 
522 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  59.72 
 
 
522 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  59.72 
 
 
522 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  59.72 
 
 
522 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  59.72 
 
 
517 aa  618  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  59.72 
 
 
517 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  57.94 
 
 
513 aa  612  1e-174  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  55.95 
 
 
518 aa  606  1e-172  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  69.03 
 
 
594 aa  605  1e-172  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  57.26 
 
 
511 aa  591  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  57.87 
 
 
515 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  57.91 
 
 
512 aa  591  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  56.69 
 
 
516 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  56.69 
 
 
516 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  56.89 
 
 
516 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  57.28 
 
 
516 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  57.17 
 
 
511 aa  582  1e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  57.26 
 
 
511 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  53.39 
 
 
509 aa  541  1e-152  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  9.29958e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  47.43 
 
 
502 aa  468  1e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  47.51 
 
 
502 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  47.47 
 
 
496 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  47.45 
 
 
512 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  47.81 
 
 
498 aa  453  1e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  46.93 
 
 
502 aa  452  1e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  46.22 
 
 
501 aa  452  1e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  46.02 
 
 
501 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  47.12 
 
 
504 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  47.21 
 
 
501 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  46.32 
 
 
504 aa  446  1e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  48.84 
 
 
503 aa  447  1e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  43.65 
 
 
520 aa  407  1e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  32.99 
 
 
489 aa  233  7e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  33.92 
 
 
535 aa  180  6e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  30.28 
 
 
586 aa  179  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  31.25 
 
 
476 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  28.73 
 
 
482 aa  175  2e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  32.89 
 
 
474 aa  174  2e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  29.62 
 
 
572 aa  170  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  30.6 
 
 
535 aa  161  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  29.78 
 
 
499 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  27.79 
 
 
526 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  30.02 
 
 
496 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  27.29 
 
 
549 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  27.94 
 
 
489 aa  154  3e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  28.57 
 
 
537 aa  154  3e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  28.82 
 
 
497 aa  153  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  30.91 
 
 
487 aa  153  9e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  29.26 
 
 
508 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  28.01 
 
 
536 aa  148  2e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  28.7 
 
 
511 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  28.67 
 
 
486 aa  148  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  28.73 
 
 
478 aa  147  4e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  29.07 
 
 
565 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  29.41 
 
 
502 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  27.1 
 
 
483 aa  144  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  28.26 
 
 
494 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  27.55 
 
 
471 aa  142  1e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  25.78 
 
 
481 aa  142  1e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  28.57 
 
 
479 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  28.73 
 
 
493 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  26.62 
 
 
519 aa  139  9e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  26.46 
 
 
473 aa  138  3e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  28.54 
 
 
523 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  27.17 
 
 
517 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  1.91984e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  29.14 
 
 
489 aa  137  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  23.21 
 
 
458 aa  135  1e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  27.51 
 
 
523 aa  136  1e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  25.48 
 
 
467 aa  135  2e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  26.61 
 
 
519 aa  134  4e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  32.01 
 
 
466 aa  134  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  26.71 
 
 
499 aa  134  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  27.46 
 
 
501 aa  133  8e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  26.87 
 
 
498 aa  133  8e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  27.81 
 
 
497 aa  132  1e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  27.67 
 
 
497 aa  132  1e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  27.67 
 
 
497 aa  132  1e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  27.67 
 
 
497 aa  132  1e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  27.33 
 
 
497 aa  132  2e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  27.23 
 
 
497 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  26.64 
 
 
497 aa  130  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  26.77 
 
 
497 aa  130  5e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  26.77 
 
 
497 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  26.77 
 
 
497 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  23.09 
 
 
480 aa  130  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  24.37 
 
 
491 aa  130  6e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  26.39 
 
 
474 aa  130  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  27.08 
 
 
508 aa  130  7e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>