More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4176 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  100 
 
 		 218 aa  418  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  49.51 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  49.76 
 
 		 222 aa  184  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  55.98 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  45.45 
 
 		 242 aa  168  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  53.01 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.54 
 
 		 228 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  45.55 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.61 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  46.51 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3445  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.75 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  48.68 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.01 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  46.15 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  40.74 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.39 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.2 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  49.21 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.47 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.47 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  39.17 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  41.01 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  41.01 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.29 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  45.12 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  45.58 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  45.02 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  42.47 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  40.37 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  41.51 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  41.51 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  40.71 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  40.47 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.21 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  41.4 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  41.8 
 
 		 246 aa  137  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  37.69 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  38.8 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  40.91 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  40 
 
 		 228 aa  131  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  37.99 
 
 		 252 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  42.5 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.49 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  40.65 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  39.72 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  39.53 
 
 		 228 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  42.5 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  39.46 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  38.57 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.33 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  38.81 
 
 		 240 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  43.62 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  43.62 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.21 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  43.62 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  43.62 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  43.62 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  32.88 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  43.62 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  45.26 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  43.09 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  40.51 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  40.38 
 
 		 230 aa  121  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.27 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  41.71 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  38.5 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  38.25 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  38.25 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  38.25 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  38.3 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.1 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  37.44 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.76 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  41.67 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  33.03 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  35.45 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  38.25 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  38.25 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  38.25 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  38.25 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  36.7 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  38.25 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  37.38 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  38.25 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  39.71 
 
 		 204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  32.09 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  36.65 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.17 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  38.07 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.36 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  32.07 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05938  hypothetical protein  31.38 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  35 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2640  HAD family hydrolase  38.77 
 
 		 237 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  36.57 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000204  putative phosphatase YieH  31.38 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  31.77 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>