49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3003 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  100 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  45.76 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  44.97 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  44.16 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  43.51 
 
 		 176 aa  148  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  43.51 
 
 		 177 aa  147  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  42.21 
 
 		 176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  41.29 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  35.33 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  35.58 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  37.42 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  34.46 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  35.29 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  31.61 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  34.09 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  34.18 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  32.08 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  37.87 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  30.57 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  30.19 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  31.65 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  30.19 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  30.77 
 
 		 179 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  33.77 
 
 		 178 aa  91.7  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  31.25 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  27.01 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  25.86 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  26.8 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  32.45 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  28.89 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  31.43 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  29.29 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  32.73 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  31.86 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  29.93 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  27.1 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  23.84 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  24.71 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  26.72 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  25.38 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  23.68 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  29.09 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  26.83 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  31.3 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  23.91 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  29.73 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  26.17 
 
 		 136 aa  41.2  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1029  hypothetical protein  22.97 
 
 		 145 aa  40.8  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.0601496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>