More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2415 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 302 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  64.24 
 
 		 303 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  64.57 
 
 		 303 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  64.57 
 
 		 303 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  63.7 
 
 		 305 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  63.04 
 
 		 305 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  60.93 
 
 		 303 aa  394  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  58.61 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  56.77 
 
 		 315 aa  358  8e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  55.78 
 
 		 320 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  54.64 
 
 		 307 aa  352  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  53.9 
 
 		 298 aa  352  5e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  54.93 
 
 		 355 aa  349  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 		 314 aa  347  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 		 309 aa  345  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  55.67 
 
 		 300 aa  345  5e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 		 302 aa  345  7e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  55.14 
 
 		 305 aa  343  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 309 aa  341  8e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  53.33 
 
 		 302 aa  340  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 303 aa  340  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  53.51 
 
 		 306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  52.94 
 
 		 321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  56.11 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 		 303 aa  333  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 		 305 aa  333  3e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 		 312 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 		 309 aa  331  7.000000000000001e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  52.51 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  52.86 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  51.51 
 
 		 307 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  51.85 
 
 		 304 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  54 
 
 		 301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  51.51 
 
 		 305 aa  325  6e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 305 aa  324  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 		 303 aa  322  5e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 		 302 aa  322  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  52.17 
 
 		 300 aa  322  7e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  53.18 
 
 		 311 aa  318  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 318 aa  318  6e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  53.18 
 
 		 311 aa  318  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 318 aa  318  7e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  51.84 
 
 		 305 aa  318  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 301 aa  318  9e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 		 304 aa  317  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  51.52 
 
 		 304 aa  318  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  51.84 
 
 		 305 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 306 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  51.5 
 
 		 312 aa  315  5e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 305 aa  315  7e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 		 308 aa  315  8e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 		 305 aa  314  9e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 		 305 aa  314  9e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  51.84 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  52 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  50.82 
 
 		 309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  51.17 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  53 
 
 		 305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 		 300 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  51.51 
 
 		 298 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  50.34 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 312 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 		 310 aa  308  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 309 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 306 aa  306  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 		 302 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  51.01 
 
 		 312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 306 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  51.35 
 
 		 312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 309 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 309 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  50.68 
 
 		 312 aa  305  6e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 309 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 309 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 309 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 309 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 309 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 318 aa  305  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 304 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 		 300 aa  305  7e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14621  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 		 308 aa  305  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.227033  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  46.82 
 
 		 329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  47.18 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 		 309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>