More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1615 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 
313 aa  643    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.34 
 
 
311 aa  455  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.4 
 
 
311 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.71 
 
 
310 aa  431  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.71 
 
 
310 aa  431  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.71 
 
 
311 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.28 
 
 
310 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.55 
 
 
310 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.8 
 
 
313 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.78 
 
 
316 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.61 
 
 
311 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  59.61 
 
 
305 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.42 
 
 
313 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.74 
 
 
313 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  61.92 
 
 
317 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.74 
 
 
313 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  59.49 
 
 
326 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.36 
 
 
307 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  57.93 
 
 
312 aa  377  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  57.79 
 
 
311 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.4 
 
 
315 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  59.48 
 
 
313 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  57.84 
 
 
312 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.93 
 
 
316 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  60.26 
 
 
320 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.07 
 
 
334 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  56.68 
 
 
313 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.93 
 
 
316 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.6 
 
 
317 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  56.44 
 
 
309 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  57.33 
 
 
306 aa  364  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.4 
 
 
315 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.4 
 
 
315 aa  363  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.09 
 
 
317 aa  362  4e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  56.03 
 
 
312 aa  362  4e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.86 
 
 
316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1359  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.27 
 
 
319 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.31 
 
 
336 aa  359  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.44 
 
 
312 aa  358  5e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.92 
 
 
317 aa  358  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2007  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.59 
 
 
362 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.75 
 
 
312 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.86 
 
 
313 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.66 
 
 
325 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.88 
 
 
323 aa  355  7.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  59.27 
 
 
311 aa  354  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  55.8 
 
 
329 aa  354  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.55 
 
 
323 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.95 
 
 
346 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.52 
 
 
315 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.38 
 
 
306 aa  353  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.55 
 
 
323 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0757  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
343 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2247  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.32 
 
 
317 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.414785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
343 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0155  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.14 
 
 
309 aa  352  5.9999999999999994e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60 
 
 
317 aa  351  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285295  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.22 
 
 
323 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2521  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
343 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0385  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
343 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
343 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677096  hitchhiker  0.0028837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0867  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
343 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  57.86 
 
 
307 aa  350  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3965  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
381 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2424  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60 
 
 
317 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.26 
 
 
322 aa  349  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
343 aa  349  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3527  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.26 
 
 
317 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.26 
 
 
322 aa  349  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1994  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
343 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165088  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.26 
 
 
322 aa  349  4e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
343 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.63 
 
 
317 aa  349  4e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.15 
 
 
307 aa  349  4e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
361 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
361 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
361 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3109  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
361 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2749  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
361 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636253  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.91 
 
 
318 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.58 
 
 
336 aa  347  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05260  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.17 
 
 
334 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.873262  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.33 
 
 
304 aa  347  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2039  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.63 
 
 
309 aa  347  2e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.485925  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.84 
 
 
334 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0397  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.21 
 
 
335 aa  346  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.76 
 
 
313 aa  345  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.19 
 
 
310 aa  345  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.87 
 
 
334 aa  345  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.52 
 
 
328 aa  345  5e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.92 
 
 
341 aa  345  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.57 
 
 
323 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.33 
 
 
318 aa  344  8e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.585187  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2893  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.11 
 
 
320 aa  345  8e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.11 
 
 
320 aa  345  8e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1353  aspartate carbamoyltransferase  56.25 
 
 
333 aa  344  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.58 
 
 
318 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.8 
 
 
334 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  53.33 
 
 
315 aa  343  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.96 
 
 
341 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>