More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1311 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  100 
 
 
473 aa  976    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  63.91 
 
 
472 aa  626  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  63.06 
 
 
472 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  62.85 
 
 
474 aa  608  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  63.06 
 
 
474 aa  608  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  62 
 
 
472 aa  598  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  60.08 
 
 
472 aa  579  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  60.34 
 
 
472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  49.04 
 
 
467 aa  450  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.34 
 
 
470 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  43.89 
 
 
470 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  43.42 
 
 
486 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  44.95 
 
 
467 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  43.74 
 
 
471 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  42.32 
 
 
475 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.91 
 
 
466 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  42.55 
 
 
475 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  40.22 
 
 
467 aa  352  8e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  39.02 
 
 
463 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  39.57 
 
 
478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  38.11 
 
 
488 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  39.12 
 
 
468 aa  329  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  37.82 
 
 
469 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  38.59 
 
 
471 aa  322  6e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.56 
 
 
484 aa  320  5e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.58 
 
 
469 aa  317  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.72 
 
 
469 aa  316  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  35.82 
 
 
474 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.32 
 
 
475 aa  311  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  39.15 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.82 
 
 
469 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  35.82 
 
 
470 aa  302  7.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.24 
 
 
464 aa  301  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.18 
 
 
469 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35.61 
 
 
470 aa  297  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  38.56 
 
 
460 aa  295  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  36.03 
 
 
470 aa  293  6e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35.96 
 
 
470 aa  292  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  39.09 
 
 
473 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  35.65 
 
 
733 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  33.47 
 
 
501 aa  282  1e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  36.59 
 
 
503 aa  280  5e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  35.94 
 
 
490 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  35.64 
 
 
460 aa  277  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  36.1 
 
 
482 aa  277  3e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.27 
 
 
460 aa  276  8e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  34.14 
 
 
474 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  34.84 
 
 
460 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  32.64 
 
 
479 aa  272  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  32.65 
 
 
486 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  34.75 
 
 
460 aa  267  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  34.99 
 
 
460 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  33.99 
 
 
460 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  33.82 
 
 
472 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  32.78 
 
 
486 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  31.57 
 
 
457 aa  263  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  34.73 
 
 
460 aa  263  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.57 
 
 
478 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  31.34 
 
 
458 aa  261  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.96 
 
 
475 aa  259  6e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  36.12 
 
 
468 aa  254  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  32.36 
 
 
485 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.29 
 
 
463 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.79 
 
 
480 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  34.47 
 
 
477 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  30.17 
 
 
484 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  30.88 
 
 
480 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.88 
 
 
480 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.16 
 
 
487 aa  245  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  33.83 
 
 
409 aa  242  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  29.96 
 
 
484 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  32.64 
 
 
487 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  33.74 
 
 
414 aa  240  4e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  30.37 
 
 
484 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.37 
 
 
487 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  34.1 
 
 
470 aa  237  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  29.55 
 
 
486 aa  229  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  32.24 
 
 
484 aa  229  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.9 
 
 
518 aa  227  4e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  29.81 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.2 
 
 
473 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  32.33 
 
 
465 aa  208  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2336  phosphoglucomutase  30.21 
 
 
550 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01345  phosphoglucomutase  31.82 
 
 
548 aa  199  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004120  phosphoglucomutase  32.02 
 
 
548 aa  199  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2238  phosphoglucomutase  29.94 
 
 
550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000108864  hitchhiker  0.00000000164585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4132  phosphoglucomutase  30.96 
 
 
553 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2196  phosphoglucomutase  29.94 
 
 
550 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000365433  unclonable  0.00000535585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1212  phosphoglucomutase  32.68 
 
 
547 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000373193  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4511  phosphoglucomutase  29.94 
 
 
550 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2225  phosphoglucomutase  29.94 
 
 
550 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000344179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1123  phosphoglucomutase  32.94 
 
 
547 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0537632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3119  phosphoglucomutase  32.88 
 
 
547 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000194945  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2146  phosphoglucomutase  29.94 
 
 
550 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000239704  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1882  phosphoglucomutase  28.96 
 
 
550 aa  195  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00767786  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1944  phosphoglucomutase  29.43 
 
 
550 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370627  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2031  phosphoglucomutase  29.24 
 
 
550 aa  192  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00697315  hitchhiker  0.000229027 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1187  phosphoglucomutase  31.64 
 
 
548 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0977339 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2134  phosphoglucomutase  29.04 
 
 
550 aa  190  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.40825  decreased coverage  0.0000149403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  30.33 
 
 
545 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>