More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2157 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0025  phosphomannomutase  73.77 
 
 		 428 aa  675    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2157  phosphomannomutase  100 
 
 		 428 aa  870    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0021  phosphomannomutase  75.7 
 
 		 429 aa  687    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0431995  normal  0.0965198 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1061  phosphomannomutase  76.64 
 
 		 429 aa  707    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  36.59 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  35.89 
 
 		 830 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  34.47 
 
 		 456 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  32.96 
 
 		 462 aa  212  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  35.21 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  36.22 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  33.56 
 
 		 457 aa  209  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  35.19 
 
 		 464 aa  209  9e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  34.17 
 
 		 462 aa  209  9e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  32.43 
 
 		 456 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  32.2 
 
 		 456 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  32.2 
 
 		 456 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  33.41 
 
 		 469 aa  206  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  32.21 
 
 		 462 aa  206  9e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  32.74 
 
 		 472 aa  206  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  35.21 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  35.45 
 
 		 488 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  35.29 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  33.94 
 
 		 881 aa  203  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  33.41 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  33.79 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.91 
 
 		 463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  34.01 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  35.16 
 
 		 854 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  33.03 
 
 		 460 aa  200  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  35.16 
 
 		 868 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  34.02 
 
 		 465 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  34.15 
 
 		 472 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  32.74 
 
 		 461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  33.93 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  34.02 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  33.94 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  33.41 
 
 		 469 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  31.84 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  30.09 
 
 		 446 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  33.71 
 
 		 465 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0623  phosphomannomutase  30.82 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  32.58 
 
 		 460 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  32.72 
 
 		 461 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  33.04 
 
 		 463 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  32.51 
 
 		 461 aa  192  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  30.13 
 
 		 450 aa  192  9e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  33.71 
 
 		 453 aa  192  9e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  33.26 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  32.28 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  33.49 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  32.05 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  32.8 
 
 		 467 aa  190  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  32.81 
 
 		 462 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  31.89 
 
 		 475 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  30.42 
 
 		 475 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  34.23 
 
 		 863 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  32.65 
 
 		 452 aa  189  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  33.63 
 
 		 782 aa  189  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  33.18 
 
 		 451 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  32.96 
 
 		 457 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  32.59 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  32.59 
 
 		 462 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0032  phosphomannomutase  30.93 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.457022  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  31.92 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  31.6 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  31 
 
 		 472 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  33.03 
 
 		 465 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  31.7 
 
 		 461 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  32.73 
 
 		 471 aa  186  7e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  32.73 
 
 		 471 aa  186  8e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  32.27 
 
 		 469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  33.56 
 
 		 782 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  33.79 
 
 		 465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  30.51 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  32.88 
 
 		 469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  31.94 
 
 		 462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  32.3 
 
 		 485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  31.58 
 
 		 458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  32.57 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2559  phosphomannomutase  32.97 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.344329  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  33.03 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  32.43 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  34.31 
 
 		 467 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  33.04 
 
 		 469 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  33.1 
 
 		 451 aa  183  6e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  33.18 
 
 		 449 aa  183  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  33.1 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  32.41 
 
 		 453 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  33.25 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  30.92 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  30.93 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  31.55 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  30.52 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  31.69 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  30.72 
 
 		 456 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  31.39 
 
 		 486 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0695  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.44 
 
 		 462 aa  179  5.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3701  phosphomannomutase  31.11 
 
 		 464 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  33.86 
 
 		 460 aa  179  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  31.71 
 
 		 462 aa  179  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>