More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0025 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0025  phosphomannomutase  100 
 
 
428 aa  867    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0021  phosphomannomutase  78.92 
 
 
429 aa  701    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0431995  normal  0.0965198 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2157  phosphomannomutase  73.77 
 
 
428 aa  675    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1061  phosphomannomutase  77.52 
 
 
429 aa  715    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  35.59 
 
 
450 aa  231  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  36.55 
 
 
881 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  35.41 
 
 
830 aa  220  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  35.28 
 
 
464 aa  216  8e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  34.62 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  35.16 
 
 
456 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  34.93 
 
 
456 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  35.16 
 
 
456 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  35.7 
 
 
868 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  35.44 
 
 
488 aa  209  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  35.21 
 
 
466 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  34.09 
 
 
465 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  35.7 
 
 
472 aa  208  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  35.47 
 
 
854 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  34.09 
 
 
465 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0623  phosphomannomutase  33.18 
 
 
452 aa  207  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  34.76 
 
 
467 aa  207  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  34.99 
 
 
463 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  33.93 
 
 
458 aa  206  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  36.76 
 
 
863 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  35.21 
 
 
466 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  34.93 
 
 
464 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  34.4 
 
 
457 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  32.88 
 
 
462 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  33.56 
 
 
450 aa  204  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0032  phosphomannomutase  30.07 
 
 
439 aa  204  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.457022  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  33.93 
 
 
468 aa  204  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  34.69 
 
 
453 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  34.4 
 
 
457 aa  203  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  34.27 
 
 
453 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  33.86 
 
 
469 aa  203  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  34.01 
 
 
469 aa  202  9e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  32.88 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  32.44 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  34.99 
 
 
465 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  33.48 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  33.11 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  33.48 
 
 
461 aa  199  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  32.81 
 
 
460 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  32.81 
 
 
460 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  35.28 
 
 
451 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  31.54 
 
 
448 aa  196  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.48 
 
 
463 aa  196  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  34.3 
 
 
465 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0206  phosphomannomutase  29.4 
 
 
437 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  31.89 
 
 
475 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  33.86 
 
 
466 aa  195  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  32.51 
 
 
472 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  33.56 
 
 
471 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  32.13 
 
 
486 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  32.47 
 
 
447 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  33.86 
 
 
447 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  30.11 
 
 
475 aa  194  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  33.56 
 
 
471 aa  194  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  29.98 
 
 
446 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  35.42 
 
 
465 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0695  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.07 
 
 
462 aa  193  5e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  33.55 
 
 
469 aa  193  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  34.25 
 
 
452 aa  192  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2559  phosphomannomutase  33.85 
 
 
460 aa  192  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.344329  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  33.85 
 
 
782 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  31.66 
 
 
472 aa  190  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  33.03 
 
 
469 aa  190  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  33.33 
 
 
460 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  31.14 
 
 
475 aa  189  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0682  phosphomannomutase  29.65 
 
 
437 aa  189  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  32.96 
 
 
455 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0617  phosphomannomutase  29.36 
 
 
437 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  31.46 
 
 
461 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  31.85 
 
 
455 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  34.62 
 
 
450 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  33.33 
 
 
459 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  35.55 
 
 
456 aa  186  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  32.49 
 
 
456 aa  186  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  34.26 
 
 
467 aa  186  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  32.59 
 
 
462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1301  phosphomannomutase  28.8 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  31.07 
 
 
448 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  31.45 
 
 
461 aa  184  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3316  phosphomannomutase  32.74 
 
 
467 aa  183  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  34.16 
 
 
469 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  33.72 
 
 
450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  32.73 
 
 
457 aa  183  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  34.49 
 
 
451 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  33.33 
 
 
451 aa  182  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  30.47 
 
 
461 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  30.96 
 
 
454 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  31.7 
 
 
462 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  31.7 
 
 
462 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  30.91 
 
 
462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  33.33 
 
 
453 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  30.63 
 
 
461 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  32.96 
 
 
782 aa  180  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2443  phosphomannomutase  32.67 
 
 
472 aa  180  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.299376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  32.87 
 
 
453 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  32.37 
 
 
454 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>