38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1136 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  672    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  73.6 
 
 		 330 aa  494  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  68.9 
 
 		 333 aa  484  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  66.46 
 
 		 335 aa  466  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1090  hypothetical protein  47.04 
 
 		 350 aa  292  6e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0867  hypothetical protein  35.13 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.530638  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  30.03 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  28.85 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  28.75 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  27.56 
 
 		 337 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  28.48 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  33.91 
 
 		 860 aa  113  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2214  protein of unknown function DUF354  28.03 
 
 		 354 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0093  hypothetical protein  28.67 
 
 		 350 aa  109  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0978162 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  28.85 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1618  hypothetical protein  26.6 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.783063  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1064  protein of unknown function DUF354  28.77 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  28.88 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  29.24 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0185  hypothetical protein  23.1 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  27.41 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  23.49 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  27.87 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  23.17 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  25.81 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2590  hypothetical protein  26.67 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  24.5 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  26.97 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  26.93 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  28.69 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  23.72 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  25.7 
 
 		 374 aa  53.1  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  22.83 
 
 		 361 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  27.75 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  26.89 
 
 		 369 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  26.97 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4579  protein of unknown function DUF354  29.59 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.242869  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3429  protein of unknown function DUF354  25 
 
 		 383 aa  42.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>