179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3064 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3064  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 438 aa  912    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0399  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 		 306 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  26.58 
 
 		 334 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 1275 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.18 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 1007 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0053  hypothetical protein  24.91 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000565511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 625 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 625 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 299 aa  54.3  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 996 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 		 958 aa  53.1  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 284 aa  53.1  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.89 
 
 		 310 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0631  glycosyltransferase protein  24.26 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  26.42 
 
 		 731 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 		 289 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 		 710 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.07 
 
 		 322 aa  52.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.48 
 
 		 851 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.48 
 
 		 851 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.48 
 
 		 851 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.42 
 
 		 851 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  28.48 
 
 		 851 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1217  general glycosylation pathway protein  27.01 
 
 		 320 aa  51.6  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 717 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 310 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 		 324 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0414  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 		 633 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 1359 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 302 aa  50.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 		 717 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 		 1334 aa  50.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 338 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 		 307 aa  50.1  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2010  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 		 360 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0314  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 		 323 aa  50.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.06758  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  29 
 
 		 329 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 350 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 		 658 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 623 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2252  glycosyl transferase family 2  23.42 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 280 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  24.53 
 
 		 292 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  26.88 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 733 aa  49.3  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 338 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 1759 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  22.65 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  38.2 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 684 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 287 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  26.88 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 670 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.58 
 
 		 610 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 617 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0044  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0042  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1101  glycosyltransferase  26.75 
 
 		 313 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 		 327 aa  48.5  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 		 1509 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 		 327 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  23.05 
 
 		 1152 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 342 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09810  glycosyl transferase  24.48 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 		 319 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 247 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1257  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 322 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3780  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 		 327 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 		 329 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  23.97 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.09 
 
 		 266 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  25 
 
 		 328 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 		 329 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2047  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 105 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1259  glycosyltransferase  26.9 
 
 		 308 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  22.86 
 
 		 373 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 1486 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 		 891 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.09 
 
 		 266 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1127  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.75 
 
 		 311 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.09 
 
 		 266 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 364 aa  47  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1219  group 2 family glycosyl transferase  26.75 
 
 		 311 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  28.09 
 
 		 266 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 330 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1288  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.75 
 
 		 311 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.679665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 		 280 aa  47  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>