More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2019 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2019  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
277 aa  568  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.757502  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6699  metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 
174 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  1.01178e-12  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5857  metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 
174 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  5.44364e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6223  metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 
174 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00123783  normal  0.0229896 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5732  metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 
174 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  6.41177e-09  normal  0.956338 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5977  metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 
174 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  4.32758e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6634  metal dependent phosphohydrolase  39.73 
 
 
174 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  3.57148e-06  normal  0.116569 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5339  metal dependent phosphohydrolase  39.73 
 
 
174 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  2.03175e-05  normal  0.0207845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3018  metal-dependent phosphohydrolase  35.19 
 
 
186 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0328781  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03360  conserved hypothetical protein  33.51 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.756492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3561  metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 
191 aa  95.9  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3243  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 
186 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4183  metal dependent phosphohydrolase  36.48 
 
 
178 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3207  metal dependent phosphohydrolase  35.22 
 
 
186 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1651  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 
202 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1802  metal dependent phosphohydrolase  35.62 
 
 
178 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.293843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5215  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 
178 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7010  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
179 aa  85.5  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.630776  normal  0.976948 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4993  metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 
239 aa  81.6  1e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3579  metal dependent phosphohydrolase  36.71 
 
 
207 aa  75.5  9e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3829  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
195 aa  73.6  3e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784768  hitchhiker  0.000801793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0326  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 
175 aa  73.2  4e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0404  metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 
182 aa  73.2  4e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.421477  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4101  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 
204 aa  73.2  5e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0293  hypothetical protein  32.03 
 
 
181 aa  72.8  5e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00349136  normal  0.154666 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3457  metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 
207 aa  72.8  6e-12  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4761  metal dependent phosphohydrolase  35.25 
 
 
192 aa  71.6  1e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.127717  hitchhiker  3.8304e-07 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0578  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases-like protein  34.4 
 
 
193 aa  70.5  3e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0575  metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 
727 aa  70.5  3e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  7.08166e-08  normal  0.0281665 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0719  metal dependent phosphohydrolase  44.71 
 
 
715 aa  69.7  5e-11  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0333  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  34.81 
 
 
207 aa  69.3  6e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.847675  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1725  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase:(p)ppGpp synthetase II  36 
 
 
728 aa  68.9  9e-11  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2005  metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 
728 aa  68.9  9e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0169756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0858  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
180 aa  68.2  1e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  normal  0.356578 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2611  metal dependent phosphohydrolase  37.9 
 
 
190 aa  67.8  2e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00847931  normal  0.339126 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2390  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase  30.91 
 
 
182 aa  66.6  4e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0973  metal dependent phosphohydrolase  31.06 
 
 
195 aa  66.6  4e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.67165 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0839  hypothetical protein  36.51 
 
 
1105 aa  65.9  6e-10  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0994214 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3417  hypothetical protein  30.54 
 
 
188 aa  65.5  1e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0520  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.38 
 
 
781 aa  64.3  2e-09  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0839645  hitchhiker  6.97847e-05 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1503  hypothetical protein  31.65 
 
 
1085 aa  64.7  2e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1501  hypothetical protein  31.65 
 
 
1085 aa  64.7  2e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4976  hypothetical protein  39.55 
 
 
184 aa  64.7  2e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0281  ppGpp 3'-pyrophosphohydrolase  39.74 
 
 
718 aa  63.9  2e-09  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0431  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.88 
 
 
715 aa  64.3  2e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1770  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  36.72 
 
 
446 aa  63.9  3e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0128  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 
199 aa  63.5  3e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0200  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.83 
 
 
714 aa  63.5  3e-09  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1744  Na-solute symporter  33.59 
 
 
641 aa  63.9  3e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.488974 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0198  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.83 
 
 
714 aa  63.2  4e-09  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0355  hypothetical protein  28.37 
 
 
1111 aa  63.5  4e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0552395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2329  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 
190 aa  63.2  4e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1186  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.28 
 
 
721 aa  62.8  5e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  4.00543e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1783  metal dependent phosphohydrolase  39.36 
 
 
177 aa  62.8  6e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3424  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase-like protein  31.33 
 
 
180 aa  62.4  7e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0259194  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2802  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.35 
 
 
750 aa  62.4  7e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.353493 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5835  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
194 aa  62.4  8e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0500  GTP pyrophosphokinase  46.34 
 
 
729 aa  62.4  8e-09  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.98391  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0483  GTP pyrophosphokinase (ATP:GTP 3'-pyrophosphotransferase)(ppGpp synthetase I) ((P)ppGpp synthetase)  45.12 
 
 
729 aa  62.4  8e-09  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.731203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4938  metal dependent phosphohydrolase  28.66 
 
 
182 aa  62.4  9e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318471  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  28.99 
 
 
1170 aa  62  1e-08  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0468  GTP pyrophosphokinase  35.64 
 
 
742 aa  61.6  1e-08  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.135158  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2968  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.82 
 
 
760 aa  62  1e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2647  RelA/SpoT family protein  33.59 
 
 
762 aa  62  1e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0342541  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2079  metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 
196 aa  60.8  2e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.397509 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1361  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.45 
 
 
703 aa  60.8  2e-08  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.011666  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1443  GTP pyrophosphohydrolases/synthetases RelA/SpoT family  32.82 
 
 
746 aa  60.8  2e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2635  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  30.83 
 
 
761 aa  60.8  2e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0971  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.09 
 
 
727 aa  60.8  2e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000148672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2203  GTP pyrophosphokinase  38.3 
 
 
462 aa  61.2  2e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.465294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2469  GTP pyrophosphokinase  38.3 
 
 
462 aa  60.5  3e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4687  GTP pyrophosphokinase  32.82 
 
 
729 aa  60.5  3e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0885  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.47 
 
 
733 aa  60.5  3e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0040  metal-dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 
1109 aa  60.5  3e-08  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  33.08 
 
 
856 aa  60.5  3e-08  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.710721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0946  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.35 
 
 
745 aa  60.5  3e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926545  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.1 
 
 
742 aa  60.8  3e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2327  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.85 
 
 
801 aa  60.1  4e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0335883  normal  0.296201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0927  hypothetical protein  30.6 
 
 
1156 aa  60.1  4e-08  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0257155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2280  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.85 
 
 
801 aa  60.1  4e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.753689  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2319  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.85 
 
 
806 aa  60.1  4e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.528198  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2608  (p)ppGpp synthetase I  33.59 
 
 
761 aa  60.1  4e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0347856  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0379  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.08 
 
 
710 aa  60.1  4e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.79 
 
 
788 aa  60.1  4e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1815  RelA/SpoT family protein  31.75 
 
 
815 aa  59.7  5e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.093472  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0563  hypothetical protein  33.33 
 
 
1121 aa  59.7  5e-08  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0552395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1805  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.75 
 
 
827 aa  59.7  5e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388708  decreased coverage  7.28185e-06 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0939  hypothetical protein  32.85 
 
 
1157 aa  59.7  5e-08  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.186942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3136  metal dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 
226 aa  59.7  5e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000599164  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0939  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.08 
 
 
732 aa  59.7  5e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0531  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.28 
 
 
749 aa  59.7  6e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.254948  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0050  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  32.12 
 
 
740 aa  59.7  6e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2260  metal dependent phosphohydrolase  28.39 
 
 
462 aa  59.7  6e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290186  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0821  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.23 
 
 
730 aa  59.3  7e-08  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1212  GTP pyrophosphokinase (ATP:GTP 3'-pyrophosphotransferase)(ppGpp synthetase I) ((P)ppGpp synthetase)  39.08 
 
 
732 aa  59.3  7e-08  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1214  RelA/SpoT protein  32.33 
 
 
709 aa  59.3  7e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2510  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.46 
 
 
732 aa  59.3  7e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00123268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0842  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.07 
 
 
817 aa  59.3  7e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461248  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0377  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  39.24 
 
 
738 aa  59.3  7e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0993  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.06 
 
 
744 aa  59.3  7e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>