26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2394 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  598  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  5.39888e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  55.56 
 
 
294 aa  314  9e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  39.87 
 
 
334 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  40.21 
 
 
311 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  39.37 
 
 
306 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  39.33 
 
 
301 aa  184  1e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  36.68 
 
 
294 aa  182  4e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  37.21 
 
 
299 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  38.69 
 
 
300 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  39.56 
 
 
279 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  2.0853e-13  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  39.86 
 
 
313 aa  172  4e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  35.22 
 
 
318 aa  169  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  35.42 
 
 
281 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  34.26 
 
 
298 aa  146  4e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  30.74 
 
 
308 aa  128  1e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  29 
 
 
299 aa  125  8e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  32.06 
 
 
271 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  34.72 
 
 
324 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3776  hypothetical protein  47.42 
 
 
102 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3849  hypothetical protein  47.42 
 
 
102 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  28.9 
 
 
275 aa  99.4  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03110  hypothetical protein  27.24 
 
 
277 aa  80.5  3e-14  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0440905  hitchhiker  1.2887e-20 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  26.16 
 
 
306 aa  78.6  1e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  24.57 
 
 
284 aa  71.2  2e-11  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0123  excinuclease ABC subunit C  21.9 
 
 
296 aa  69.7  6e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  37.36 
 
 
375 aa  42.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>