58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0571 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0571  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  357  7e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.487342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  99.44 
 
 		 177 aa  353  5.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  74.86 
 
 		 177 aa  269  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1587  hypothetical protein  69.32 
 
 		 177 aa  256  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1962  hypothetical protein  67.43 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0548542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0730  hypothetical protein  65.91 
 
 		 177 aa  246  8e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0604  hypothetical protein  61.71 
 
 		 177 aa  230  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0550  hypothetical protein  43.75 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2017  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.5 
 
 		 208 aa  97.8  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00337979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1427  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.17 
 
 		 218 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1303  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.5 
 
 		 211 aa  90.9  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4056  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.31 
 
 		 204 aa  84.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022799  hitchhiker  0.00000194913 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.21 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  47.56 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  47.56 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  51.22 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.37 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0492  hypothetical protein  25.84 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.717698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.87 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.42 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.29 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  34.31 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3099  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.47 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422914  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.62 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.53 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.87 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.34 
 
 		 122 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1003  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.9 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0632  biopolymer transport protein ExbD, putative  31.31 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.362389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.39 
 
 		 135 aa  50.8  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.29 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0054  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 129 aa  48.9  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  39.74 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.35 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2764  hypothetical protein  29.59 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.7 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  38.75 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  37.5 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2016  hypothetical protein  32.86 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  22.99 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 136 aa  42  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.29 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  27.42 
 
 		 145 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.42 
 
 		 145 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.72 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  28.79 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.06 
 
 		 136 aa  41.6  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  32.79 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  20.11 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.19 
 
 		 140 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  20.11 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 		 142 aa  41.2  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.92 
 
 		 134 aa  41.2  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.92 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>