33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3440 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 504 aa  1001    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  84.33 
 
 		 504 aa  840    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  37.73 
 
 		 501 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  35.93 
 
 		 506 aa  283  8.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  31.64 
 
 		 507 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  33.1 
 
 		 497 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3724  O-antigen exporter/flippase  30 
 
 		 496 aa  211  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  20.82 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 468 aa  57  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 		 488 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 		 488 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 		 488 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  21.57 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 478 aa  51.2  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  20.28 
 
 		 488 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  20.8 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  19.48 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  20.81 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  20.93 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  20.93 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  20.81 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 498 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  20.93 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  20.93 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  20.93 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  20.19 
 
 		 429 aa  47  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  20.47 
 
 		 424 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  26.45 
 
 		 486 aa  43.9  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3785  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 442 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>